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按物种拆分blast本地库
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) 是我们常用的短序列比对工具,直接输入fasta格式的序列文件就可进行比对
Blast比对软件
蛋白质比对软件 blastp psi-blast phi-blast
BLAST比对原理就是基于序列的相似性,推断该序列的同源基因,又根据同源基因具有相同功能,从而达到功能注释的目的,这个方法往往是有效的。尽管方法会误判(假阳性)或漏判(假阴性),但目前还没有能替代相似性推断同源性的方法,只能通过设置合理的阈值,尽量减少假阳性和假阴性的发生。但相似性并不能证明同源性。
基因家族复制基因查找之手动查找-blast
NCBI的blast功能你了解多少?
blast中的m8结果文件格式介绍
分离NR NT库,快速blast本地比对同源注释基因
blast 结果说明
我们作比对时经常用到blast,其比对结果一般都用m8格式(即参数是 -m 8,blast+是 -outfmt 6),但是结果文件中是没有表头的,这里来写一下。