bedtools - 组学大讲堂问答社区

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bedtools 对bed 文件进行排序

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安生水发布于 2023-06-05 11:35

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统计每个窗口内SNP变异位点数量

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安生水发布于 2023-04-07 16:20

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从fasta基因组中提取反向互补序列

从fasta基因组中提取反向互补序列，借助bedtools工具。 bedtools getfasta -fi Dlong_asm_chr.fasta -bed DlNIP.bed -s -fo DlNIP.bed.fa -fi 基因组文件 -bed 基因位置共6列：【染色...

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rzx 发布于 2023-02-27 14:22

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Bedtools的简单使用—文件格式转换

利用Bedtools进行文件格式转换

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fangs 发布于 2021-09-30 15:35

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利用bedtools统计VCF文件中各染色体不同区域中的变异数量

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omicsgene 发布于 2020-06-30 13:55

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bedtools统计序列中碱基含量

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安生水发布于 2018-11-09 14:05

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bedtools批量提取基因组指定位置序列

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安生水发布于 2018-11-09 13:02

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bedtools求交集

bedtools求交集其用法： bedtools intersect [OPTIONS] [-a|-abam]-b BED 输入文件是bed格式，至少三列，分别...

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安生水发布于 2018-10-19 11:30

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bedtools安装报错cc1plus: error: unrecognized command line option "-std=c++11"

bedtools 安装报错

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omicsgene 发布于 2018-09-29 10:56

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提取bam/sam文件指定区域reads

若想要从sam或bam文件中提取指定区域内的reads，可以使用samtools和bedtools来实现。首先准备一个区域信息文件。region.bed #第一列为染色体ID，第二三列分别为起始终止位置 ...

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安生水发布于 2018-05-18 09:34