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重测序遗传变异过滤

CaiMJ 2024-11-29 21:14:11

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老师，在第三步vcf文件过滤时，得到的all.clean.vcf文件太小了，宽松设置调整数值后，依旧很小，怎么办啊，有没有其他的方法，可以让最后的数据大一些啊

啊呀。 2024-11-06 23:46:44

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怎么过滤vcf文件中INFO列中的DP参数？

李念 2024-08-01 18:25:29

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怎么过滤vcf文件中INFO列中的DP参数？

李念 2024-08-01 18:23:11

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变异结果质控过滤，去掉低质量变异结果时报错i

马杰宇 2024-04-30 16:00:15

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vcftools过滤除了等位基因选项外，其他参数通通没用

薄信 2024-03-22 15:42:45

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在singularity中复现遗传进化中数据过滤时出现以下信息导致clean.vcf.gz大小不符合demo

WHR 2024-03-04 16:56:00

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vcftools --vcf GT_AGCT_Liujingyan.vcf --max-missing 0.5 --maf 0.05 --remove-indels -- min-alleles 2 --max-alleles 2 --minDP 2 --minQ 20 --recode -- stdout >SNP_filter_maf0.05_miss0.5.vcf在这基础上增加杂合率，激昂杂合率设为80%或者60%，如果是自交系或纯合体，杂合率设为10%-20%怎么改

追梦 2024-01-03 10:50:45

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遗传图谱构建中群体SNP检测与开发

Mr Dong 2023-10-11 10:29:10

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#Fst 群体间多样性差异 vcftools Error: Unknown option:

猫爪草 2022-01-10 12:11:20

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在用vcftools提取指定区域文件的时候出现的以下warning是什么意思，对提取文件有没有影响？

杨辉 2021-03-04 10:41:49

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VCFtools过滤时结果里什么都没有是为什么

小土豆 2021-02-15 14:58:32

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你好，我想问一下，我想从大的vcf文件里面提取出我想要的多个个体，我要怎么操作呢?搞了好久没搞明白

徐文 2018-12-26 20:13:53