awk - 组学大讲堂问答社区

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awk正则表达式使用外部变量

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omicsgene 发布于 2024-02-04 11:35

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将fasta序列多行变单行——使用 awk 或 seqkit 或 python

fasta序列多行变单行

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星莓发布于 2022-12-26 16:03

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awk统计文件某列中某关键词出现次数

有时我们需要统计文件的某列中某些词出现的次数，可以在Linux下使用sort | uniq -c，那用awk怎么操作呢?

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星莓发布于 2022-10-12 18:29

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awk将多行序列变为一行（Fasta序列文件）

将多行序列变为一行|删除ID后的注释信息并将ID与seq分行>输出新文件

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rzx 发布于 2022-05-24 16:23

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AWK如何跳过文件的第一行

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安生水发布于 2021-12-02 14:10

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GFF文件格式不标准，第三列只有mRNA处理方法

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omicsgene 发布于 2019-05-07 15:48

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awk批量输出不同分类内容至不同文件

awk 将文件内分属不同类型的数据输入到不同的文件

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Daitoue 发布于 2019-03-21 15:25

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awk匹配替换gsub

awk中gsub可以进行匹配替换： gsub(A,B)在$0中利用B替换A gsub(A,B,C)在指定的C中用B替换A 以数据test为例（TAB分隔）： ABCD abcd HJIKEL AbDE SGWA 全部替换 A字符换成DA字...

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Daitoue 发布于 2018-12-14 10:28

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从基因组注释信息GFF文件中提取所有基因位置信息-AWK

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omicsgene 发布于 2018-12-03 16:47

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linux命令之AWK

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omicsgene 发布于 2018-11-27 17:35

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利用awk 对某一列数据取对数

awk 具有内置算术函数log(x)，以e 为底可以对数据取对数运算，而以其他数值为底进行取对数可以基于这一函数进行转换，譬如以2为底取对数： log(x)/log(2)即可。下面针对数据第二列进行取对...

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Daitoue 发布于 2018-09-30 13:57

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awk基本参数解释

awk擅长于对文件按行操作，每次读取一行，然后进行相应的操作。 awk读取单个文件时的基本语法格式是 awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}{print $0, $1;}' filename 读取多个文件时的语法是 awk...

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landy 发布于 2018-05-25 10:29

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awk筛选差异基因

命令行筛选差异基因

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landy 发布于 2018-05-24 18:03

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awk 判断并筛选数据

在linux上利用awk对数据进行筛选，并输出

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Daitoue 发布于 2018-05-17 09:41