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wgCNA一个模块中找hub基因 我把cytoScapeinput-edges文件输入cytoscape中 用cytohubba计算 但是每次出来的结果都不一样 试了很多遍也不行 求解答 谢谢!
WGCNA
李勇男
2024-06-02 08:05:13
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我得到转录组分析的wgcna数据需通过cytoscape筛选关键模块的hub基因,边的权重应该设定多少来筛好
Cytoscape
hub gene
hub基因
WGCNA
小凶饼甘
2024-05-21 00:24:16
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WGCNA中过滤低表达量(0.5)时datExpr0=datExpr0[1:n,datExpr0[n+1,] > meanFPKM]不成功,且变量从上步30769变成了0. ?
WGCNA
naliupeony
2024-02-29 18:22:42
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跑WGCNA,用的独享服务器,报错
WGCNA
静默如初
2023-11-24 21:50:19
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我想咨询一下wgcna问题
WGCNA
Iok
2023-06-30 15:52:32
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回答
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WGCNA表型信息表
WGCNA
良人不知深情
2022-09-11 12:24:10
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老师您好,我在做WGCNA分析时,无法打开'9.Module_membership文件,相关报错截屏和操作文件已发布,请问老师,是哪一步出了问题?该如何解决?谢谢老师。
lncRNA
WGCNA
李承晔
2022-07-21 17:34:07
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WGCNAcor相关系数的选择
WGCNA
良人不知深情
2022-07-07 18:15:26
0
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1692
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请问大家有没有遇到过这种情况,根据某一模块的MM和GS散点图筛选的hub基因会分布不同的module,也就是说不全在该module下
WGCNA
梁大山
2022-04-15 16:39:17
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老师您好,我在转录组数据中筛选了一个转录因子(NAC),前期我对这个转录因子相关的6个基因做了克隆及表达分析,现在问题是怎样将这些基因的表达量和转录组数据的转录因子表达量联系起来?
WGCNA
仲吕廿八
2021-10-12 22:47:24
1
回答
2546
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做WGCNA分析时,得到的CytoscapeInput-edges文件都是空的,请问该如何解决?
WGCNA
2021-07-25 21:40:42
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WGCNA可以将来自不同组织的表达量数据放在一起计算吗
WGCNA
转录组
weishang
2021-06-07 01:14:37
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回答
3459
浏览
WGCNA如何只提取某一模块到Cytoscape中来绘制网络?
模块
网络图
WGCNA
丁子楠
2021-04-19 16:47:10
1
回答
3067
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老师您好,我在做WGCNA分析时,得到的CytoscapeInput-edges文件都是空的,请问该如何解决?谢谢老师。
WGCNA
李承晔
2021-03-20 22:55:27
1
回答
3170
浏览
老师您好,请问不同GSE号的数据可以联合起来做WGCNA分析吗?该如何将不同的Gene_expressionMatrix文件都加载进去?谢谢老师。
WGCNA
李承晔
2021-03-09 14:00:04
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