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请教一下TCGA的蛋白数据怎么理解，它是有正负值的，这个正负值代表什么意思，为什么蛋白表达会有负值？我只想给它分成高表达，低表达和表达缺失组应该怎么处理呀？

• TCGA

• 卡西莫多 2024-12-09 11:01:00

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TCGA下载 docker报错

• TCGA

• 失败算什么 2022-06-28 11:35:31

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3487浏览

TCGA差异分析如何根据临床信息分组？

• TCGA

• heiwei 2022-03-21 23:08:50

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TCGA用R数据下载错误

• TCGA

• 答案tan90° 2021-11-09 09:48:39

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老师，想请教一下TCGA基因表达数据的问题，我从xena.ucsc网页上下载了基因表达数据TCGA-CESC.htseq_counts.tsv；然后发现该数据中只有Ensembl格式的基因ID ，没有SYMBOL格式的。所以接下来进行基因ID格式转换，却发现同一个SYMBOL ID对应的多个Ensembl格式的ID，想问下老师，这种情况该怎么处理？同一个SYMBOL ID所对应的多个Ensembl格式ID的基因表达数据应该留下哪一个？

• 生存分析
• TCGA
• 基因表达数据下载

• Bella 2021-10-25 16:15:08

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TCGA的RNA-seq count annotation过滤，有些不知道是否需要删除

• TCGA
• 样本过滤

• 一个正常的ID 2021-10-19 23:32:29

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代码报错

• TCGA

• 冯鳗鱼 2021-09-24 21:02:25

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tcga_gene_exp_download.r 运行后只得到临床数据，为啥的不到基因表达的counts，tpm，fpkm

• TCGA

• Gre 2021-08-31 17:17:04

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tcga_gene_exp_download.r -p TCGA-STAD -m 下载tcga数据，过程中进程多次在同一个地方被killed

• TCGA

• Lei 2021-08-30 00:41:41

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老师好，R包一直安装失败不知道怎么回事，Bioconductor上的安装出现问题，如图所示（但是加载的话不报错！），还有就是VIP还是没通过呀，我子订单也提交了

• TCGA
• TCGAbiolinks

• 齐鹏举 2021-07-09 08:59:44

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3138浏览

在TCGA构建ceRNA网络，数据用代码下载不完全啊

• ceRNA
• TCGA

• YYL 2021-03-11 20:19:44

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电脑内存不能升级，运行Rstudio内存一直上升，请问还有其他方法解决这个问题吗。

• TCGA

• 可乐 2020-10-31 09:33:21

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gdcRNADownload(project.id = 'TCGA-CHOL', + data.type = 'RNAseq', + write.manifest = FALSE, + method = 'gdc-client', + directory = rnadir)

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• TCGAbiolinks

• 逐影 2020-10-30 20:40:58

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4588浏览

为什么在使用TCGAbiolinks包下载数据时会出现以下问题呢？

• R
• TCGA
• TCGAbiolinks

• Ananas 2020-08-28 17:07:08

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R4.0.2版本没有read_delim函数，怎么读取临床数据？

• R
• TCGA

• 杨娃娃 2020-07-30 22:48:52