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数据格式发生变化
应该是文件名称的问题，样品名之间是用了空格分开的吧？你检查一下 1、修改样品名 2、或修改读取代码 read.table（sep="\t") 添加一个分隔参数
回答于 2018-09-19 11:43
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请问wgcna怎么获得模块hub基因与该性状数据的相关性
应该是模块内所有点和hub对应的 Ki 以及这些点和性状的GS 吧，如此才可能能构成两列的二维数据，从而在图上构成散点图？？？没仔细看论文，猜测是这样的 GS vs kin
回答于 2018-09-19 11:08
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请问，有些文献中，给出的KME值，在WGCNA教程中，生成的"10_GS_a...
课程中并未涉及这部分内容，KME的计算过程可以参考文章：https://www.omicsclass.com/article/381
回答于 2018-09-14 09:21
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WGCNA分析，计算了软阈值，为什么powerEstimate没有提供估计值？
1、先认R2 2、就你的数据 计算power值已经到32，数据经过32次幂对应的网络会使得连通性很小，这样得到的网络很难得到hub基因 3、总的而言，对应的数据并不是很适合进行分析，即使分析获得结果可靠性也不高
回答于 2018-09-12 18:13
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WGCNA分析，官网给出的代码中两次计算了dissTOM，两次代码不一样...
1、如果不确定可以通过查看二者的结果是否有明显的差别 2、第一个代码是分步，选定power后： datExp---adjaceny--TOM--dissTOM过程，第二个是直接由选定power：datExp——dissTOM 理论上一个分步，一个一步，涉及的背景理论和算法应该一致，具体通过结果查看是否存在明显区别即可。
回答于 2018-09-12 11:36
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WGCNA分析中，β值未达到0.8，计算机给出的β估计值为1，我觉得不...
可以的，这种估计结果有的时候回明显不对，譬如1的情况，可以按照需求自己判断取一个相近的R2值对应的beta去进行下一步计算
回答于 2018-09-06 18:07