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18小时前 回答问题
可以参考一下我们示例数据使用的文章材料方法部分的描述：
3天前 回答问题
你这行代码是哪个脚本里的，我们课程里面没有用到这个软件把
5天前 回答问题
“发现P-Value的原始文件有NaN的情况”，应该是你有些SNP位点缺失率过高之类的情况，大概是你前期的数据过滤不是很严格，你画图的时候直接删掉这样的数据就可以
2025-03-13 18:24 回答问题
我们脚本里没有使用过这个参数PointSize，而且你调用一下软件的使用帮助也没有相关参数说明：
2025-03-13 18:19 回答问题
如果你用这个参数（minGQ）过滤之后过滤掉很多位点的话，可以酌情考虑不过滤，还是以你的参考文章为主；BLUP脚本和物种没有关系，是多年多点数据的话可以使用；如果你的位点缺失率比较高的话，可以用beagle做一下填充；GWAS课程相关内容请咨询客服
2025-03-13 18:00 回答问题
你这个plink是1.9吗，你可以用2.0版本的plink试试，再就是你的内存不够
2025-03-13 17:56 回答问题
这个改起来比较麻烦，针对你的数据改图属于个性化分析内容，如有需要请：联系客服
2025-03-13 17:50 回答问题
这一步不是在合并p值，是在合并snp位点和上下游10kb区域的位置信息，需要做
2025-03-13 17:46 回答问题
10%是为了捕获的基因多一些，这个参数没有一个固定的标准，视你自己的实际分析情况和你参考的文章为准
2025-03-12 17:07 回答问题
二代测序数据可以做GWAS分析，5x有点低了，但是可以根据深度相应的调整分析参数和过滤标准