9小时前 回答问题

你检查一下你的genelist文件给的对吗，路径和文件名，你的变量$ref能echo出来吗

16小时前 回答问题

如果是需要我们调试的个人数据，处理起来比较麻烦的，是需要付费的项目，如有需要可以联系客服：点击联系客服

1天前 回答问题

你检查一下pairid文件里面的基因对有没有正常生成，如果只有一个基因是成不了对的，还有检查一下你的pep和cds文件，是不是正常的，如果你的基因序列没有提取成功，后面做分析的时候也会有问题

1天前 回答问题

你参数用的不对吧： tabix -p vcf vcf.gz

2天前 回答问题

不应该会有这种情况，如果你的PAV_gene.list文件里面有的话就会被拆出来的，你检查一下文件每一行是否都有换行符，我记得你上次的问题就是因为最后一行没有换行符？另外就是检查一下列与列之间是否是tab分割的。

2天前 回答问题

tsv和vcf不是两种特殊的文件类型，重点在于如果你要做后续的分析的话需要把文件整理成参考数据的格式，你这个是单一样本的结构变异结果吗，那你需要用SURVIVOR工具去做一个合并，把样本间相同的结构变异merge到一块，方便后续信息提取。

3天前 回答问题

下次可以描述问题清晰一些，你说的怪如果是觉得图例的比例太大的话，可以把格子调大一些，间接的缩小图例： cellwidth=8, cellheight=8,

3天前 回答问题

你这个创建容器的时候报错了，报错内容来看是有些文件丢失了，你重新load一下？另外你不用手动的修改fa文件的内容，根据流程跑就可以

2025-02-11 14:53 回答问题

bcftools应该是要求输入的文件是bgzip压缩格式或者是非压缩格式： 你的输入文件应该是gzip压缩的？你可以解压vcf之后跑一下看看

2025-02-11 10:46 回答问题

同学你对这条指令的理解有误，如果你前面没有错误的话，当前的cds和pep文件的序列名称应该是每一条基因最长转录本的转录本id，这条指令的运行是为了把转录本id替换成对应的基因id，如果有问题，建议检查前面的指令是否运行有误