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kaks分析时候基因的txt文件中基因的出现乱序如何使用代码进行统...
我们的代码里面有对文件进行正确拆分的部分： 你是从上一步完整的跑下来的吗，如果你的PAVlist和示例数据格式一样的话不应该会出现这样的问题
回答于 1天前
从https://ricerc.sicau.edu.cn/下载的基因组和gff文件进行水稻...
你需要给我们提供一下明确的报错信息截图，你可以看一下发表问题的规范：https://www.omicsclass.com/article/82 因为软件报错的原因有很多种，需要有针对性解决
回答于 1天前
老师，合并后的VCF文件，现在有几品种不想要了，如何从总的VCF文...
如果你的vcf文件格式规范的话，你可以试一下vcftools：https://www.omicsclass.com/article/647
回答于 1天前
老师您好，针对这个问题https://www.omicsclass.com/question/77...
“发现P-Value的原始文件有NaN的情况”，应该是你有些SNP位点缺失率过高之类的情况，大概是你前期的数据过滤不是很严格，你画图的时候直接删掉这样的数据就可以 关于你提出的曼哈顿图上面的点显示不全的问题，你可以对脚本进行如下的修改： scale_y_continuous(expand = c(0,0.05) 即把脚本中的y轴坐标轴上限增加5％
回答于 2025-03-19 16:32
在进行GWAS的LDBlock可视化中，在Win11本地的Docker执行LDBlockS...
我们脚本里没有使用过这个参数PointSize，而且你调用一下软件的使用帮助也没有相关参数说明：
回答于 2025-03-13 18:24
GWAS分析发现的问题如下：第一，过滤水稻vcf的RawData时（群体有...
如果你用这个参数（minGQ）过滤之后过滤掉很多位点的话，可以酌情考虑不过滤，还是以你的参考文章为主；BLUP脚本和物种没有关系，是多年多点数据的话可以使用；如果你的位点缺失率比较高的话，可以用beagle做一下填充；GWAS课程相关内容请咨询客服
回答于 2025-03-13 18:19
我在win11本地GWAS分析时，进行plink。结果报错了（Segmentation...
你这个plink是1.9吗，你可以用2.0版本的plink试试，再就是你的内存不够
回答于 2025-03-13 18:00
采用你们课程的：Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r 以...
这个改起来比较麻烦，针对你的数据改图属于个性化分析内容，如有需要请：联系客服
回答于 2025-03-13 17:56