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106 个回答

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老师您好,我正在做泛基因家族分析中,家族成员存在缺失分析,需...

awk 'FNR>1{print $1"\t"$2"_"$3}' 26Pan-genes.list > 26mazi.pan-genes.list

回答于 21小时前

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泛基因集构建中JCVI做共线性分析构建完一半数据报错

last报错应该是因为内存不足:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 1天前

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正在运行命令的docker因为断网后重启还可以继续运行上次的代码吗...

你这应该是没有跑完,你看下结果有没有正常生成,建议你重新执行一下计算kaks的指令,另外你不用把之前的容器删除掉,你这个容器还是up的状态,直接attach重连就行: docker attach 你的容器id

回答于 2天前

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kaks分析时候基因的txt文件中基因的出现乱序如何使用代码进行统...

我们的代码里面有对文件进行正确拆分的部分: 你是从上一步完整的跑下来的吗,如果你的PAVlist和示例数据格式一样的话不应该会出现这样的问题

回答于 5天前

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从https://ricerc.sicau.edu.cn/下载的基因组和gff文件进行水稻...

你需要给我们提供一下明确的报错信息截图,你可以看一下发表问题的规范:https://www.omicsclass.com/article/82 因为软件报错的原因有很多种,需要有针对性解决

回答于 6天前

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老师,合并后的VCF文件,现在有几品种不想要了,如何从总的VCF文...

如果你的vcf文件格式规范的话,你可以试一下vcftools:https://www.omicsclass.com/article/647

回答于 6天前

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pav分析,在写文章的时候应该如何写怎么到PAV呢?我是通过课程输...

可以参考一下我们示例数据使用的文章材料方法部分的描述:

回答于 2025-03-24 13:15

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fastsimcoal

你这行代码是哪个脚本里的,我们课程里面没有用到这个软件把

回答于 2025-03-21 11:23

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老师您好,针对这个问题https://www.omicsclass.com/question/77...

“发现P-Value的原始文件有NaN的情况”,应该是你有些SNP位点缺失率过高之类的情况,大概是你前期的数据过滤不是很严格,你画图的时候直接删掉这样的数据就可以 关于你提出的曼哈顿图上面的点显示不全的问题,你可以对脚本进行如下的修改: scale_y_continuous(expand = c(0,0.05) 即把脚本中的y轴坐标轴上限增加5%

回答于 2025-03-19 16:32

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在进行GWAS的LDBlock可视化中,在Win11本地的Docker执行LDBlockS...

我们脚本里没有使用过这个参数PointSize,而且你调用一下软件的使用帮助也没有相关参数说明:

回答于 2025-03-13 18:24