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105 个回答

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老师您好,为什么在gwas最后的筛选关联区域SNP信息时,总报错错...

建议使用我们课程中提供的docker镜像进行分析

回答于 2024-08-05 11:33

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无法打开docker镜像

同学,work 文件夹和后面的镜像名称之间是要有空格的,正确写法应该是 -v ~:/work  omicsclass/organelle-assembly:v1.0

回答于 2024-08-05 11:32

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请问老师这里显示找不到pav文件怎么办,这个文件是有的

同学,每一个脚本前面都有一个配置环境变量的过程,你需要执行一下的:

回答于 2024-07-19 14:03

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只提取出来一个是为什么呀?是不是不对呀?

同学,你这个给的信息比较少,根据你现在的这个情况,你首先检查一下你鉴定到的家族基因的基因id是否和列表中能够对应上,如果能对应上只是你鉴定到的基因不在列表里的话,那说明这些基因的同源性比较差,你要考虑针对你的基因家族,选择一些近缘的基因组了。另外同一个问题提一遍就可以了哈,注意一下提问技巧,看一下这个...

回答于 2024-07-18 11:54

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绘制PPI互作网络报错

同学,我需要你给我看看你的输入文件: TF_fpkm.xls WRKY_deg_fpkm.xls meta.2.txt 还有你运行的指令 还有如果你生成了一些cor开头的文件也给我看下吧

回答于 2024-07-09 11:49

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单倍型报错

同学,你执行R脚本的时候-c 参数应该给的是分析的染色体编号,我看你给的这个染色体编号怎么好像和gff文件里对不上,你再检查一下看看是不是,另外再提醒你一下,这个-s 和-e的参数是你要分析的所有snp位点的最开始那个snp和最后一个snp位点的位置(如果是基因的话就是基因在染色体上的起始和终止位置),不要填错了哈

回答于 2024-07-05 09:43

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运行时没有报错,pairid也是和demo里的内容一样,我没上直播,但...

同学,你跟我说的是没有报错信息的,但是你这个是报错了的哈,你看一下你这条命令是exit的状态,他提示你有一个基因的序列是不存在的,你看到了吗,你看一下你前面B97的基因组是不是不完整的,没下载完或者是没处理完: 另外提问的时候注意提问技巧,可以看一下这个帖子:https://www.omicsclass.com/article/82

回答于 2024-06-27 11:37

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泛基因家族ka/ks分析,生成 .axt文件时报错,查看直播回放发现老...

这就有点奇怪了,由于同学你提出了这个问题,我重新跑了一下流程里ParaAT比对的这一步,就是你贴出来的这条指令: 是能够跑出来有结果的axt文件的,这是运行中会产生的一些日志内容,你的运行过程也是这样的吗: 结果axt: 所以现在我也不是很清楚为什么你会出现这种跑出来空的结果文件的问题,空的结果会不会是没跑...

回答于 2024-06-27 10:33

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这条命令报错cat ../id.txt|while read ind;do cut -d" " -f1 ./...

同学,现在你的目录底下有check文件夹吗,首先这个报错是提示你在check文件夹中找不到相关的fa文件和fas文件,你可以看看是不是前一步没有正确操作导致的

回答于 2024-06-25 14:05

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老师,绘制PAV图时,结果如图,还有报错信息

同学,发一下你输入的绘图文件截图,给你看一下

回答于 2024-06-21 09:40