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老师您好 我用tassel软件跑MLM模型时，按照程序跑了好几遍一直报...
同学你的报错信息显示“No genotype data remained after filtering”，说明通过参数进行过滤后所有的snp都被过滤掉了，你可以贴一下你的指令，并且调整一下你的参数 ，有可能是参数设置的过于严格导致的。
回答于 2024-11-26 15:59
是否可以将同源聚类的结果命名成TPS1/2/3
这个主要还是看你自己的研究内容，如果给家族基因命名的话，你也可以基于基因在染色体上的位置进行排序（比较推荐），当然像你说的直接按照从上到下的TPS1、TPS2往下排属于没什么生物学意义的排序方法，看你的分析目的。
回答于 2024-11-20 09:26
AWK整理泛基因集文件出现部分问题
同学你这个，直接awk -F"\t" '{print $1"\t"$2"_"$3}' 13Pan-genes.list > apple13.pan-genes.list 就可以，因为你这个基因名字中间有"_"，所以会被拆成两个字段，要是不理解的话可以再看看awk的使用
回答于 2024-11-06 15:08
老师，请问selective sweep analysis如何分析
同学，选择清除分析是我们遗传进化的课程内容，目前的话我们有多种方法去做，有基于多样性的（FST和π），有基于位点频谱变化的（xpclr和tajimaD），你可以去了解一下相关的分析工具，因为这个分析比较复杂，如果有学习的需求的话可以买我们课程学习的。
回答于 2024-11-01 10:20
购买服务后，原课程账号需要下载什么文件，转移到新买的服务器账...
同学你买的是录播课吗，那你直接把你当前下载的资料挪过去就行，就是demo data shell script，数据资料是可以联系客服获取的：点击联系客服
回答于 2024-10-29 09:32
07.SV_and_gene_expression中删除一些不需要的基因的表达量后文...
同学，你看一下你表达量文件的基因id和你的PAV_gene.list对不上呀，你要统一一下，要和示例数据保持一致
回答于 2024-10-28 17:43
03.PAV 提取物种独有的家族基因时，出现killed ，不能进行代码操...
同学，我们给每个学员分配的内存是有限的，出现这种情况应该是你的内存占用达到了上限，我们不建议你使用我们提供的练习服务器运行大内存任务，如果有这种比较大的数据要做分析的话可以看一下这：windows 中的docker如何设置容器的内存与计算资源 hyper-V - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass.com)
回答于 2024-10-28 09:28