CaiMJ
CaiMJ - 科研人员

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8 个回答

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老师您好,我按照课程提供的流程泡自己的数据,在fst pi tajim...

解决了吗?我也出现这种问题,pi.wild.windowed.pi 染色体ID与fai文件的染色体ID是一致的,只是大小写的区别,有影响吗?

回答于 2024-07-22 20:40

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二代数据质控

图是这样的

回答于 2024-03-15 15:35

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ALLHIC显示找不到sample.bwa_mem.bam

错了,确实没有sample.bwa_mem.bam这个文件,但是有sample.bwa_aln.bam

回答于 2023-11-29 18:56

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gene_stat显示final_gene_stat/all_gene_structure.tsv: Permiss...

python3 $scriptsdir/GeneStats_noSplice.py -g augustus.evm.format.gff3 -s $species -o augustus_gene_stat -S Augustus python3 $scriptsdir/GeneStats_noSplice.py -g snap.evm.format.gff3 -s $species -o snap_gene_stat -S SNAP python3 $scriptsdir/GeneStats_noSplice.py -g genemark.evm.format.gff3 -s $spec...

回答于 2023-11-09 18:09

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MYSQL做pasa_update的时候报错

我也出现同样的问题,请问你后来是怎么解决的?

回答于 2023-10-21 22:00

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braker.pl运行中断

在GeneMark-ET.stdout文件中最后报错: error, file not found /share/work/biosoft/GeneMark-ES/GeneMark-ES-v4.69/gmes_linux_64_4/parse_ET.pl: set.out error on call: /share/work/biosoft/GeneMark-ES/GeneMark-ES-v4.69/gmes_linux_64_4/parse_ET.pl --section ET_A --cfg  /work/genome/annotation/output/docker...

回答于 2023-10-19 13:09

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重复序列鉴定

是用的你们的docker镜像omicsclass/genome-annotation:v1.0,修改脚本权限之后就可以运行了,谢谢老师!

回答于 2023-10-11 16:22

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同一物种批量注释基因组

求基因组注释流程。我用genome-annotation注释的时候,用funannotate mask报错,显示缺失“tantan“依赖项

回答于 2023-09-20 21:18