2024-06-04 19:24 发起提问

2024-05-21 15:34 回答问题

老师您好，我的数据是双端测序。代码经过比对也没发现问题。下面是我根据课程pipline改的操作流程代码和sam文件、bam文件里的部分内容，麻烦老师评估一下是哪里出了问题，非常感谢您： #hisat2软件，链特异性文库设置 #--rna-strandness RF or FR #非链特异性文库，不设置此参数 for i in PBS1 PBS2 PBS3 DL125PS1 DL125PS2 DL125PS3; do echo "RUN CMD: hisat2 -p 1 --rg-id=${i} -

2024-05-21 09:40 发起提问

2024-04-22 11:34 发起提问

2024-04-18 17:11 发起提问

2024-03-21 16:25 发起提问

2024-03-21 16:22 发起提问

2024-03-01 18:18 发起提问

2023-10-07 17:53 回答问题

使用的代码是 Rscript $scriptdir/enrichKEGG_pip.R --deg.file $workdir/5.deg/normal_vs_tumor.DEG.final.tsv -o KEGG -n normal_vs_tumor --pvalueCutoff 1 --ann.db org.Hs.eg.db --organism hsa --idtype ENSEMBL --totype ENTREZID 

2023-10-07 17:15 发起提问