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发起提问 · 2024-10-25 18:12 老师，在生成gbcf文件后，发现只运行了前三个染色体的，是我的代码有问题嘛？该怎么解决啊？参考基因组的fasta，fai文件都是好的，前期生成的bam文件也是好的，样品是四倍体，参考基因组是异源四倍体
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登录 · 2024-10-25 08:41
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发起提问 · 2024-10-24 23:55 老师，我的db文件夹里显示了所有染色体都已经导入，但是在将gvcf转换成vcf时，发现在Lc2Ns染色体就结束完成了，这是正常现象嘛，是我使用的近源种参考基因组的原因嘛？我的是简化基因组测序的
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登录 · 2024-10-24 23:47
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发起提问 · 2024-10-22 12:08 老师，问题比较复杂，麻烦您看一下详细的问题描述
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登录 · 2024-10-22 11:20
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发起提问 · 2024-10-21 16:30 老师，我有141个样品，现在IndexFeatureFile，tabix，bcftools都无法成功构建gvcf的索引，只有CSI格式能成功索引，这个格式在后续也用不了，这个gvcf索引还有其他的解决办法嘛，还是说我只能重新生成vcf文件了
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登录 · 2024-10-21 15:47
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登录 · 2024-10-20 00:37
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发起提问 · 2024-10-19 14:48 按照您昨天提供的IndexFeatureFile 工具来构建gvcf文件索引时，依旧出现报错现象，无法索引，怎么办