15 个问题

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• 老师，我在做dadi分析的时候，发现没有代码里显示的easySFS.py的脚本，给的文件里也没有，就一直报错

  1/83

  1天前
• 老师，我想做一下分子方差分析AMOVA，咱们有相关的代码嘛，好多群体遗传文献里有这个分析，不知道咱们可以提供嘛？

  1/242

  2025-02-21 17:19
• 你好老师，我想请问一下，有没有代码可以计算群体的多态性信息含量PIC值，观察等位基因数A，有效等位基因数Ae啊，ddRAD测序做的分析有限，想增加点分析

  1/664

  2024-12-04 20:17
• 老师，我在分析PSMC时，出现无法查找到染色体名称，fa文件里面的命名是这个样子的，该怎么办啊

  1/514

  2024-11-29 21:33
• 老师，在第三步vcf文件过滤时，得到的all.clean.vcf文件太小了，宽松设置调整数值后，依旧很小，怎么办啊，有没有其他的方法，可以让最后的数据大一些啊

  1/685

  2024-11-06 23:46
• 老师，麻烦您解答一下

  0/726

  2024-11-03 12:23
• 老师，在生成gbcf文件后，发现只运行了前三个染色体的，是我的代码有问题嘛？该怎么解决啊？参考基因组的fasta，fai文件都是好的，前期生成的bam文件也是好的，样品是四倍体，参考基因组是异源四倍体

  1/765

  2024-10-25 18:12
• 老师，我的db文件夹里显示了所有染色体都已经导入，但是在将gvcf转换成vcf时，发现在Lc2Ns染色体就结束完成了，这是正常现象嘛，是我使用的近源种参考基因组的原因嘛？我的是简化基因组测序的

  1/746

  2024-10-24 23:55
• 老师，问题比较复杂，麻烦您看一下详细的问题描述，小麦基因组

  2/974

  2024-10-22 12:08
• 老师，我有141个样品，现在IndexFeatureFile，tabix，bcftools都无法成功构建gvcf的索引，只有CSI格式能成功索引，这个格式在后续也用不了，这个gvcf索引还有其他的解决办法嘛，还是说我只能重新生成vcf文件了

  1/756

  2024-10-21 16:30