11 个问题

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• 老师，在第三步vcf文件过滤时，得到的all.clean.vcf文件太小了，宽松设置调整数值后，依旧很小，怎么办啊，有没有其他的方法，可以让最后的数据大一些啊

  1/150

  2024-11-06 23:46
• 老师，麻烦您解答一下

  0/149

  2024-11-03 12:23
• 老师，在生成gbcf文件后，发现只运行了前三个染色体的，是我的代码有问题嘛？该怎么解决啊？参考基因组的fasta，fai文件都是好的，前期生成的bam文件也是好的，样品是四倍体，参考基因组是异源四倍体

  1/143

  2024-10-25 18:12
• 老师，我的db文件夹里显示了所有染色体都已经导入，但是在将gvcf转换成vcf时，发现在Lc2Ns染色体就结束完成了，这是正常现象嘛，是我使用的近源种参考基因组的原因嘛？我的是简化基因组测序的

  1/281

  2024-10-24 23:55
• 老师，问题比较复杂，麻烦您看一下详细的问题描述，小麦基因组

  1/253

  2024-10-22 12:08
• 老师，我有141个样品，现在IndexFeatureFile，tabix，bcftools都无法成功构建gvcf的索引，只有CSI格式能成功索引，这个格式在后续也用不了，这个gvcf索引还有其他的解决办法嘛，还是说我只能重新生成vcf文件了

  1/240

  2024-10-21 16:30
• 按照您昨天提供的IndexFeatureFile 工具来构建gvcf文件索引时，依旧出现报错现象，无法索引，怎么办

  1/241

  2024-10-19 14:48
• 成功得到了gvcf文件后，合并gvcf文件时，在导入db步骤中，由于gvcf文件超出了idx索引的处理范围，因此我使用CSI建立索引后，发现导入db的代码依旧无法运行，需要idx格式的索引，怎么办

  2/332

  2024-10-16 17:34
• 老师，我按照多样本的代码生成gvcf文件后，发现并没有视频里讲解所说的tbi格式的索引文件，这是怎么回事呢，我需要怎么做啊

  1/270

  2024-10-15 18:43
• 在对bam文件进行排序时，因为参考基因组太长，出现这两个报错，会影响后续分析嘛

  1/398

  2024-09-26 10:51