Connie
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17小时前 发起提问

老师，我的基因组有113个，今天运行整理泛基因集列表中共线性分析生成pangene.bed和pangene.cds那一步，已经运行了18个小时了，才运行到79个基因组，其他步骤也是，比较慢，有没有快一点的方法呢？与网络有关系吗，换一个快的网线能加快进度吗？

3天前 发起提问

构建泛基因列表，提取最长转录本这一步，运行几个小时之后没有结果是怎么回事？

2025-02-14 20:45 关注了问题

请问，在3个数据库中进行结构域确认时，为什么我出不来和老师一样的结果，是不是使用的_pep_need_to_confirm.fa文件里面基因名称一行需要修改？

2025-02-14 20:42 发起提问

请问，在3个数据库中进行结构域确认时，为什么我出不来和老师一样的结果，是不是使用的_pep_need_to_confirm.fa文件里面基因名称一行需要修改？

2025-02-13 16:20 回答问题

老师，我更换镜像了，但本地镜像一直加载不了，显示如下。然后，我在服务器上，导入镜像，运行docker run -it --rm --name pangene --group-add keep-groups -v /home/us132/pangene:/w

rm -rf ~/

2025-02-13 15:34 发起提问

老师，我更换镜像了，但本地镜像一直加载不了，显示如下。然后，我在服务器上，导入镜像，运行docker run -it --rm --name pangene --group-add keep-groups -v /home/us132/pangene:/w

2025-02-12 16:38 发起提问

泛基因家族分析时，泛基因集构建与家族成员分析用的镜像不同，有区别吗

2025-02-12 16:33 回答问题

老师，我正在执行泛基因及构建的12-30行的指令；视频中data数据中为gff的后缀，我的数据是gff3的，把他后缀改成gff重新上传一遍在执行这条指令吗？

我试过了，需要把指令中gff改成gff3

2025-02-11 21:07 回答问题

请问利用jcvi整理泛基因列表，做JCVI做共线性分析时，一直提示/bin/bash: lastdb: command not found，是没有安装Last软件包吗？目前使用的镜像是购买课程时老师提供的，数据是26个玉米基因组数据（由于空间不足，只用了1

我是不是需要安装LAST呢？但安装了好久，一直安不上

2025-02-11 15:34 发起提问

请问利用jcvi整理泛基因列表，做JCVI做共线性分析时，一直提示/bin/bash: lastdb: command not found，是没有安装Last软件包吗？目前使用的镜像是购买课程时老师提供的，数据是26个玉米基因组数据（由于空间不足，只用了1