发起提问 · 2025-03-07 10:55 老师,我正在做泛基因家族分析,在构建泛基因列表时,整理完matrix.txt文件,进一步进行矩阵整理时,得到的pangene.txt为什么都是nogene呢,另外,我们老师,我正在做泛基因家族分析,在构建泛基因列表时,整理完matrix.txt文件,进一步
发起提问 · 2025-03-06 21:30 老师我在构建泛基因列表,合成last.txt文件,结果只有两列
登录 · 2025-03-06 10:03
发起提问 · 2025-03-06 08:16 老师我在做泛基因家族分析里面的泛基因列表构建,生成last.txt文件非常慢,帮忙修改命令
发起提问 · 2025-03-04 09:05 老师,我在构建泛基因列表时,做cat pangene_filter.*lifted.anchors | grep -v "^#" | awk '{print $1"\t"$2}'> ../03.jcvi-pan-vs-genome/syn.txt这一步,找
发起提问 · 2025-02-28 06:17 老师,构建泛基因列表使用的vcf文件,是下面图中的sv数据吗,下面表格包括了CHROM,POS,REF,ALT,TYPE,MAF,MIS,ANN,将这些数据整理成vcf吗?
回答问题 · 2025-02-27 21:22 老师,在泛基因列表构建时,总共113个基因组,成功提取了最长转录本,提取bed文件,但提取cds文件时,有一个文件A10总是失败,不知道什么原因。
发起提问 · 2025-02-27 15:17 老师,我在做泛基因列表时,提取最长转录本都成功提取,但其中一个基因组一直无法提取cds,后来查看提取出的转录本格式一样,但有些内容可能与其他基因组不一样(下载数据时,这个基因组格式是gff3,其他为gff,提取最长转录本时我把他改为了gff),您那边是否可
注册 · 2025-02-27 15:06
发起提问 · 2025-02-26 15:25 老师,在泛基因列表构建时,总共113个基因组,成功提取了最长转录本,提取bed文件,但提取cds文件时,有一个文件A10总是失败,不知道什么原因。