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31 个问题
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老师,为什么cds和pep提取不出来?提取出来是0
1/192
2025-02-11 10:10
#提取cds 用基因的id,作为序列的id;;1.这条指令如何修改,我想保留第一个pbr013511.1,这条指令只能保留中间部分 2.提取完cds和pep后,>DAnjou后面的内容,没有基因ID,ANQ为他的gff3文件 3.同样也是提取完cds和pep之后,>后面内容无基因id;DL为gff文件
1/184
2025-02-10 16:44
老师,这是某一个最长转录本的保留;;请问#Ensembl 下载的基因组 会在基因和mRNA ID前面加gene: 和 transcript:这里给去掉;;这条指令是不是对应下图中要删除掉ID后面的gene mRNA exon CDS等信息呢?
0/173
2025-02-10 15:18
如何确保.fa和gff3文件的染色体编号一致?手动修改吗;以下是两个基因组的gff和fa
2/188
2025-02-10 15:04
老师,保留最长转录本中,过程文件出现了take into account
0/169
2025-02-10 14:58
老师,保留最长转录本之后,提取cds和pep,过程出现这个界面,请问哪里有问题吗?
1/169
2025-02-10 13:15
老师,这个done之后不动了,开始运行了吗?如何判断呢?
1/179
2025-02-10 13:02
老师,软连接以后,我的样本名后面加了?这样对吗 在软连接时,我将Rstudio中的gz去掉了,因为我的data数据没有gz
2/198
2025-02-10 11:19
ls ../data/*.fa. |sed -e "s/.fa.//g" -e "s#../data/##g" > ../id.txt执行这条命令的时候,未能得到id.txt文件;2.想问一下:每次关掉putty的时候,都需要重新dockers run进入吗?3.软连接之后发现01.data prepare里面有玉米的数据了如何删除此01.data prepare?4.现在发现需要上传id.txt文件,将11个样本名输到txt文件里面,通过filezilla上传到data,再进行docker run?
1/190
2025-02-08 23:02
如何删除01.data prepare呢?
1/168
2025-02-08 22:40
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