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请问老师我跟着重测序课程做到了VCF过滤这步,是不是三种方法任意...
老师 最后一步vcftools我过滤5G的数据只得到了10M的数据，这步是不是可以省略不做了。
回答于 2024-10-07 15:35
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picard处理后的bam文件被gatk识别为多个样本怎么办？
sam文件流程:bwa mem -t 10 cankaojiyinzu.fa YZ26_T240604_0090_1.fq.gz YZ26_T240604_0090_2.fq.gz > YZ26.sam bam流程: samtools view -bhS -t cankaojiyinzu.fa.fai -o YZ26.bam YZ26.sam bam到去除重复都是按照重测序分析课程流程的命令进行的.gatk分析命令也是按照重测序课程进行的, 报错问题: A USER ERROR ha...
回答于 2024-09-14 14:32
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请问老师我同学做简化基因组做物种鉴定，遇到这种问题。
我同学是学医的，药剂，只是老师感兴趣突然让她做的，她也不懂，都是公司安排的，现在公司也上不了班。这个是公司给的候选序列鉴定物种。
回答于 2020-02-27 11:03
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请问老师基因家族单纯的只做视频那一套+荧光定量，能发sci吗？不...
请问老师要是 基因家族+转录组+荧光定量可以发高分文章吗？ 我的做的油菜，NCBI有油菜各个组织的转录组数据，都是10G+的。
回答于 2020-02-16 18:24
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请问老师我下载了根，茎，叶，花，种子的转录组数据，怎么做成基...
请问老师是不是过程 和全基因组关联分析一样，和物种的全基因组数据bwa,samtools生成bam文件，再cuffdiff或者htseq-count进行分析，用edger分析得到gene的各种log2FoldChange pval PADJ等数据，再将筛选的处理的家族geneid挑出来进行热图绘制吗?
回答于 2020-02-16 15:29
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老师，我用perl script/select_redundant_mRNA.pl去除冗余，结果...
回答于 2019-05-08 12:33
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