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采用你们课程的：Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r 以...
关于你提出的曼哈顿图上面的点显示不全的问题，你可以对脚本进行如下的修改 找到y轴设置 修改一下： 即把脚本中的y轴坐标轴上限增加5％ qqplot 也一样：
回答于 2025-03-14 18:50
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GWAS做关联区域分析时，根据p值获取关联区域中，为什么要用如下...
bedtools merge 加上P值是因为，上一步flank 取的是p值两边的region，如果不加pvalue.bed 会出现空档： https://bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/tools/merge.html
回答于 2025-03-14 08:35
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我在win11本地GWAS分析时，进行plink。结果报错了（Segmentation...
看看这个：https://www.omicsclass.com/article/1891
回答于 2025-03-14 08:32
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cellchat的netVisual_bubble
刚刚测试了一下，可能是cellchat的bug，可以换成细胞类型序号绘制这个图，下面的代码获得细胞序号： print("设置感兴趣的细胞类型对应的细胞序号")print(paste(1:length(levels( cellchat@idents )),levels( cellchat@idents ),sep=":")) #单独的 print(paste(1:length(levels( cellchat2@idents$joint )),levels( cellcha...
回答于 2025-03-10 10:56
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老师 请问这个运行时需要很久吗，上面显示的需要7天
这个库在我吗云服务器上已经有了，不需要下载：/share/database/eggNOG/emapperdb-5.0.2/
回答于 2025-03-09 07:47