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性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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3976 个回答

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xpclr绘图

基因少,你自己用adobe illustrater 软件手动编辑PDF文件标注;

回答于 10小时前

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dadi

建库用的参考基因组,和vcf里面的参考基因组不一致,你检查检查,要用同一套基因组,版本也有相同;

回答于 10小时前

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通过GWAS分析找到显著snp后,对这个snp进行单倍型分析,把群体分...

不知道你用什么方法检验的,没有显著性,可以换成 Wilcox秩次检验试试;

回答于 10小时前

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请问跟着教程做的时候,无法下载omicsclass/reseq:v1.1,老师您...

联系客服处理:点击联系客服

回答于 10小时前

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服务器连接断网

登录不上是你多次错误的输入用户名或者密码,导致服务器认为受到黑客攻击禁用了你的IP; 你可以找后台管理员处理一下:登录服务器的时候有个欢迎界面有qq群你加一下,或者找联系客服处理:点击联系客服

回答于 5天前

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dadi

2D 这个文件夹当前文件夹没有,你创建一下,再运行命令 mkdir 2D 

回答于 6天前

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xpclr绘图

fai文件里面的染色体号和xpclr的要一致; 你自己换也行; 最好是配套的,别搞错了;

回答于 6天前

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xpclr绘图

检查所有输入文件里面的染色体ID是否一致; 还有长度过滤是否设置过大;

回答于 6天前

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根据覆盖度及比对率如何剔除样品、gatk VariantFiltration过滤

数据分析具有探索性,没有绝对的最好的过滤参数,不同的项目数据特点和分析目的都会有不同的过滤参数; 这个需要自己去摸索,或者参考文献,设置合理的参数得到 质量和数量合适的SNP数量; 一般建议: 最低 4X,缺失率 0.7 ,深度低的样本建议可以去除; 其他种的样本建议放在一起CALL SNP,构建进化树;后续做GWAS...

回答于 2025-01-13 11:30

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重测序

没有办法接着继续GATK不支持,中途断开了只能重新跑;

回答于 2025-01-10 09:40