擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS
生物信息
你的30X测序只是平均测序深度,实际测序并不均匀,一般基因组上有重复区域重复越多深度会很高;
回答于 2024-07-09 09:13
链接文件路径写错了,你重新链接一下,应该是data吧,你写成date了;
回答于 2024-07-09 09:12
看看其他的方法也行,有几个方法通过即可;
回答于 2024-07-08 09:27
看看其他有么有注释到基因ID的; 结构变异有的比较复杂,可能导致找不到基因;
回答于 2024-07-08 09:26
系统文件打开数目限制,你找你的系统管理员解决一下; 或者按照错误提示设置一下;
回答于 2024-07-08 09:25
可能是NCBI上下载的基因组GFF格式不标准,导致程序报错;
回答于 2024-07-08 09:22
建议用vcftools 处理; 不知道你所说的 非变异位点 是什么样子的, 建议截图说明,或者吧你的命令行贴一下,才好给你指出错误;
回答于 2024-07-08 09:21
有些参数你没有设置,导致程序运行不了;
回答于 2024-07-08 09:20
这个你可以自己在VCF文件里面找到对应区域的SNP,自己整理一个表格出来绘制一个热图即可;
回答于 2024-07-04 10:02
我们的流程没有在singularity中测试,建议使用docker分析数据,
回答于 2024-07-04 10:00