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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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4032 个回答

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请问老师。镜像启动是哪里出错了

后台没有这个镜像吧,你docker images 查看一下后台镜像 docker images

回答于 2025-03-12 09:16

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cellchat的netVisual_bubble

刚刚测试了一下,可能是cellchat的bug,可以换成细胞类型序号绘制这个图,下面的代码获得细胞序号: print("设置感兴趣的细胞类型对应的细胞序号")print(paste(1:length(levels( cellchat@idents )),levels( cellchat@idents ),sep=":")) #单独的 print(paste(1:length(levels( cellchat2@idents$joint )),levels( cellcha...

回答于 2025-03-10 10:56

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老师 请问这个运行时需要很久吗,上面显示的需要7天

这个库在我吗云服务器上已经有了,不需要下载:/share/database/eggNOG/emapperdb-5.0.2/

回答于 2025-03-09 07:47

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老师,想问一下meme.html怎么在网页中打开呢?

filezllia下载下来打开,或者用rstudio-server在线打开;

回答于 2025-03-06 10:56

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老师,我运行这条命令报错了,请问哪里出问题了 ,感谢老师

命令行中的引号要用英文书法下输入,你改下

回答于 2025-03-05 18:48

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怎么从泛基因组call SNP呢?

这个课程里面有讲的:https://bdtcd.xetlk.com/s/lIqL9

回答于 2025-03-05 18:47

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重测序分析

这个地方需要改一下,你的染色体编号有4吗?  -L 也后面可以跟一个文件,里面一条染色体一行:  chr.list

回答于 2025-03-05 12:16

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你好,我也遇到了一样的问题:docker里omicsclass的镜像都搜索不...

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回答于 2025-03-03 09:31

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老师您好,我在参考基因组比对的时候出现报错

双端测序 一个样本两个文件是一对,不要搞错了,你检查你的输入文件

回答于 2025-02-28 22:33

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老师您好,在参考基因组比对时出错。

这个变量bwa基因组索引文件路径没有设置是空的,你看看前面的代码设置一下:

回答于 2025-02-28 17:38