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老师,我这个是桑树的fasta和gff文件,不是从官网下载的。假如各...

只要是标准的 基因组fasta格式和GFF文件格式就可以应用到我们的分析数据的流程中; 你可以打开文件看看和我们提供的示例文件格式是否一致;

回答于 2024-06-24 13:21

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上传CNCB测序数据出现问题,请问大佬们需要怎样处理啊?

这个需要处理数据,数据有问题;

回答于 2024-06-24 13:20

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老师,用admixture做群体结构时,可以绘制单独一个k值的结构图吗...

我们的脚本输出的文件有PDF版本的额,你可以把pdf图片导入 adobe illustrater 中手动修改字体,或者删除其他K值的图片;

回答于 2024-06-24 13:19

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老师您好,我按照课程提供的流程泡自己的数据,在fst pi tajim...

这个文件的染色体ID(pi.wild.windowed.pi )和fai文件的染色体ID核对一下: 染色体ID 严格区分大小写,要一模一样才行

回答于 2024-06-23 11:16

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老师 您看一下 这个是hic的测序方法

测序方法都差不多,我是说你这个数据是华大测序仪出来的数据,数据格式可能有兼容问题,我们没有测试华大测序仪的数据;

回答于 2024-06-21 17:40

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老师,下面是报错、染色体信息、gff文件中的染色体和命令行

上面不是有提示吗,那个转录本没有基因,你在GFF里面搜索一下看看有啥异常,看不出了就截图我帮你看看;

回答于 2024-06-20 15:20

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泛基因家族分析,提取CDS序列结果如图所示,并且文件大小只有38K...

检查一下是什么原因导致很多基因没有提取到cds序列;主要看看GFF文件格式是不是标准,与基因组是否对应

回答于 2024-06-20 11:42

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基因家族新版解压总是报错,无法获取更新后的脚本

请联系QQ群里的工作人员:787097236

回答于 2024-06-19 18:43

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对于同一种系来源的生物体的基因组(比如都是人类的基因组),我...

基因组DN A的数据不存在批次效应,主要是 SNP要准确;

回答于 2024-06-19 18:41

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老师 您说bwa比对哪里 能正常生成,就是在allhic对congtig分grou...

你把你hic测序输入文件的read1 和 read2 文件开头分别head一下截图我看看数据是不是成对的;

回答于 2024-06-19 09:12