omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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物种间共线性分析报错

查一下这个报错的基因ID，在bed文件里面和simple文件里面是否都能搜索到；

回答于 2024-06-05 10:21

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你这个我看不到报错信息，你可以把运行过程中的报错信息也贴一下，不然我猜不到你哪里出错了；

回答于 2024-06-05 10:19

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是可以的额，有文章这样做

回答于 2024-06-04 17:47

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对的，这是phylip文件格式的限制，样本名字最多10个字符，多出的字符自动截掉了，你可以自己修改一下样本名字再分析这部分内容；

回答于 2024-06-04 17:32

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确保是同一套基因组，如果有对应列表可以对起来；如果没有建议你下载原始fastq文件做一下你的参考基因组的转录组分析：这里有视频课程你可以看看：https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM

回答于 2024-06-04 09:59

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提示你的两个sai文件生成错误，你重新生成一下：

回答于 2024-06-04 09:57

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对的左边的图没有体现；

回答于 2024-06-03 09:37

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这是最后一行吗，你看看后面是否还有其他染色体；如果只有一条染色体，你看看前面分析数据的是不是有问题，比如参考基因组是不是只有一条染色体？

回答于 2024-06-03 09:32

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有参数限制一下长度，不要显示哪些短的scaffold

回答于 2024-06-03 09:30

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没生产文件，看看有什么报错吧；没在windows下用过这个，建议用我们的docker分析吧：https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp

回答于 2024-05-30 12:40