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3937 个回答

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我使用hmmsearch时弄出来的文件是空文件夹这是为什么嘛? 我下载...

没生产文件,看看有什么报错吧; 没在windows下用过这个,建议用我们的docker分析吧:https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp

回答于 2024-05-30 12:40

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安装~/velocyto.py 报错

换一种安装方法: git clone https://github.com/velocyto-team/velocyto.py.git cd velocyto.py python3 setup.py install 如果有包包错没有,可以直接用pip安装: pip3 install Cython  pysam loompy

回答于 2024-05-29 09:33

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老师 下面这个问题需要怎么解决呀 希望老师能给我解决这个问题...

你的命令行应该改一下,怎么还是Hind III呢,当然跑步过去了; mboI 和dnpⅱ 两种酶切位点一样,用哪个都行;

回答于 2024-05-28 16:32

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单细胞测序数据FindAllMaker查找不同Cluster的Marker基因时报错

可能是由于选择的差异分析方法和筛选条件太严格,导致没有找到差异的marker基因,你可以换个方法,并且降低筛选条件,例如: Rscript $scripts/seurat_FindAllMarkers.r --rds $workdir/05.cell_type_ann/pbmc.added.celltype.rds \ -p FindAllMarkers --test.use  wilcox   --logfc.threshold 0.2 例如这里有文献用M...

回答于 2024-05-28 09:46

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老师您好,做完蛋白序列多序列比对后,分析基因家族的保守位点,...

多看看自己研究的家族保守结构域的特点,再看看比对后序列上保守的碱基就知道了; 例如下面的,WRKY比对结果,一看WRKY就知道了: 再对比一下 WRKY保守结构域的motif,就知道了,红色箭头处保守的氨基酸:

回答于 2024-05-28 09:42

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老师您好,亚细胞定位预测出来的结果很多,需要都写上吗

一般选第一个就可以;

回答于 2024-05-28 09:36

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老师请问,这种OG0000.。。代表的基因家族扩增还是收缩问题,他...

家族的收缩和扩张看后面的数字是正负,正扩张,负收缩; 至于具体是什么家族,需要做找到家族对应的基因序列,做功能注释才行;

回答于 2024-05-28 09:34

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docker 运行报错

看你的容器没有在运行,你的docker容器启动命令行是不是有问题,你可以贴一下帮你看看; 这里解决,你可以先删除容器再重新启动一个容器; docker rm -f 858a00217673 #删除容器;

回答于 2024-05-28 09:31

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老师我想问一下这个挂载是不是有问题呢

可能是端粒,你看看具体的序列;端粒是重复序列你可以用软件鉴定一下,这个课程里面有: https://bdtcd.xetslk.com/s/nr634

回答于 2024-05-27 09:15

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挂载过程中遇到以下问题需要怎么处理

可能是内存不够吧,你多给些内存给docker:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2024-05-27 09:06