没生产文件,看看有什么报错吧; 没在windows下用过这个,建议用我们的docker分析吧:https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp
回答于 2024-05-30 12:40
换一种安装方法: git clone https://github.com/velocyto-team/velocyto.py.git cd velocyto.py python3 setup.py install 如果有包包错没有,可以直接用pip安装: pip3 install Cython pysam loompy
回答于 2024-05-29 09:33
你的命令行应该改一下,怎么还是Hind III呢,当然跑步过去了; mboI 和dnpⅱ 两种酶切位点一样,用哪个都行;
回答于 2024-05-28 16:32
可能是由于选择的差异分析方法和筛选条件太严格,导致没有找到差异的marker基因,你可以换个方法,并且降低筛选条件,例如: Rscript $scripts/seurat_FindAllMarkers.r --rds $workdir/05.cell_type_ann/pbmc.added.celltype.rds \ -p FindAllMarkers --test.use wilcox --logfc.threshold 0.2 例如这里有文献用M...
回答于 2024-05-28 09:46
多看看自己研究的家族保守结构域的特点,再看看比对后序列上保守的碱基就知道了; 例如下面的,WRKY比对结果,一看WRKY就知道了: 再对比一下 WRKY保守结构域的motif,就知道了,红色箭头处保守的氨基酸:
回答于 2024-05-28 09:42
家族的收缩和扩张看后面的数字是正负,正扩张,负收缩; 至于具体是什么家族,需要做找到家族对应的基因序列,做功能注释才行;
回答于 2024-05-28 09:34
看你的容器没有在运行,你的docker容器启动命令行是不是有问题,你可以贴一下帮你看看; 这里解决,你可以先删除容器再重新启动一个容器; docker rm -f 858a00217673 #删除容器;
回答于 2024-05-28 09:31
可能是端粒,你看看具体的序列;端粒是重复序列你可以用软件鉴定一下,这个课程里面有: https://bdtcd.xetslk.com/s/nr634
回答于 2024-05-27 09:15
可能是内存不够吧,你多给些内存给docker:https://www.omicsclass.com/article/1413
回答于 2024-05-27 09:06