3937 个回答
1 赞同
0 赞同
1 赞同
重测序
可以整理一个样本数据文件列表，第一列为样本ID，第二列为fq1的文件绝对路径，第三列为fq2的文件绝对路径；把for循环替换成while 循环； 例如： cat data-path-list.txt | while read i fq1 fq2;dobwa mem $BWA_INDEX $fq1 $fq2 -t 1 -M \ -R "@RG\tID:${i}\tLB:${i}\tPL:ILLUMINA\tSM:${i}" \ |samtools...
回答于 2024-05-09 12:06
0 赞同
扩增子：真菌ITS分析unite不匹配
是使用的我们的课程代码吗：https://bdtcd.xetslk.com/s/qZRiF 如果是的，你这个输入文件（ $dbdir/qiime2/unite_ver9_99_25.07.2023-Q2-2023.7.qza）写错了，脚本里面不是这个文件
回答于 2024-05-09 10:23
0 赞同
你好老师 为什么我一直提示磁盘超额 Filezilla也一直传输文件失...
培训服务器只做练习使用，分配的存储空间有限不能分析自己的数据，如果要分析自己的数据可以购买我们的云服务器：https://study.omicsclass.com/index
回答于 2024-05-08 15:53
0 赞同
0 赞同
基因组重测序使用qualimap 出现Exception in thread "main" java...
用的是我们的docker镜像分析的吗？如果不是那就是软件环境配置问题， 建议用我们提供的docker镜像分析；
回答于 2024-05-07 13:18
0 赞同
beeswarm添加box图后的legend颜色设置问题
ER 这变量需要是因子才行：as.numeric(as.factor(ER)) 如果是字符串转换不了整数；
回答于 2024-05-07 10:17
0 赞同
0 赞同