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泛基因家族mkdir文件夹显示已存在，但目录里没有任何内容
你需要把要分析的数据用filezillia上传到服务器才行。 linux基础课需要学习一下：https://bdtcd.xetlk.com/s/17gwqZ
回答于 2024-12-01 08:22
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genome
这个你要看看文件说明，或者自己打开看看的； 我推测 chr版本是染色体的，不包含其他scaffold； 另外文件是包含所有序列的，如果要完整的话建议选择这个文件； 具体还需要你去打开文件观察验证的；
回答于 2024-11-29 11:03
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老师，就是我把重测序个体分为三组进行SNP扫描，然后把三次扫描...
样本多建议每个样本先生成GVCF，再合并。 你贴的haplotypecaller命令生成的是VCF不是GVCF，下面的代码合并会会报错： 大样本 call SNP 生成GVCF这部分内容重测序课程里面有，你看看的：点击学习：https://bdtcd.xetlk.com/s/1VQOjQ
回答于 2024-11-29 07:19
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老师您好，我们在水稻泛基因组数据库https://ricerc.sicau.edu.c...
是不是fa格式你可以打开文件看看的；linux里面用less打开文件； fasta 也是文本文件，windows 打开文件：https://www.omicsclass.com/question/42 fasta格式定义：https://zh.wikipedia.org/wiki/FASTA%E6%A0%BC%E5%BC%8F 如果是fasta格式就可以分析；
回答于 2024-11-26 13:48
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