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自己运行Shell脚本的过程和课堂介绍的不同，请问是否提示我运行...
看看那个.o 文件，有没有报错； 如果没有报错，是因为程序运行到不同阶段，看上去进程不一样；正常现象
回答于 2024-06-27 16:16
iqtree2 iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -m TEST -B 1000 -bn...
这里的编码就没问题，除此之外可能报错：https://www.omicsclass.com/article/409
回答于 2024-06-27 11:12
老师，为什么我找的家族在本物种里的结构域会这么少呢？换了个物...
家族基因的数量，不同的家族数量差异大； 你查查文献看看相同的家族在近源物种中的数量。如果数量也差不多这么多说明没问题；如果差异太大可能有问题； 有问题你检查输入的基因组蛋白数量全不全是否有遗漏等；
回答于 2024-06-26 17:42
iqtree2 iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -m TEST -B 1000 -bn...
转换的phy文件打开看一下，这里DNA的核酸编码：https://www.omicsclass.com/article/409，是不是还有其他字符？ 检查一下；
回答于 2024-06-26 17:36
RNA 速率分析Pseudotime vs latent time
Depending on what mode you run scVelo in (the default stochastic model or the dynamical model) you will get a metric called velocity_pseudotime (stochastic) or latent_time (dynamical) the differences are in how it calculates the splicing model but they're both metrics of cell's position in time li...
回答于 2024-06-26 07:19
PSMC分析没有查到mutation rate
对的可以参考亲缘关系近的物种：例如单子叶植物或者双子叶植物有通用的突变速率：https://www.omicsclass.com/question/896
回答于 2024-06-25 13:54