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Error running system command: </biosoft/annovar/2018Apr16/ta...
VCF文件没有格式问题，检查你的ANNOVAR的库是不是构建正确
回答于 2024-04-22 15:32
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16S扩增子分析中聚类分析出现问题。
这个脚本有两个输入文件，你看看你的$metadata 文件，第50行是不是有问题； 如果在windows编辑文件，建议用专业的文本编辑器，避免windows和linux的兼容问题：https://www.omicsclass.com/article/395
回答于 2024-04-22 11:38
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不同组扩增子数据长度差距太大，如果一起分析是不是结果不太好，...
不同批次的数据qiime2数据可以分开分析再合并： https://forum.qiime2.org/t/how-to-analyze-together-different-batches-of-samples/15524 https://docs.qiime2.org/2024.2/tutorials/fmt/ 如果长度差异太大建议：看看这个：https://forum.qiime2.org/t/merging-two-projects-with-different-raw-file-types-to-perfo...
回答于 2024-04-22 10:50
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LDdecay衰减距离如何确定？
LD衰减距离是R2最大值与最小值中间的值对应的距离就是平均衰减距离；课程里面有讲的：https://bdtcd.xetslk.com/s/3QzQFb 不平滑和你的群体数据有关系，个体差异数量等；
回答于 2024-04-22 09:14
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plink怎么设置样本的PPID，MID，Sex信息？
这个你查一下plink的文件格式帮助信息：https://www.cog-genomics.org/plink/1.9/formats
回答于 2024-04-22 09:10
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