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plink怎么设置样本的PPID,MID,Sex信息?

这个你查一下plink的文件格式帮助信息:https://www.cog-genomics.org/plink/1.9/formats

回答于 2024-04-22 09:10

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老师好,我用自己的数据根据参考基因组挂在染色体这一步,最后画...

这个地方换成你的染色体ID:

回答于 2024-04-22 09:06

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tassel跑glm模型报错et.maizegenetics.pipeline.TasselPipeline...

可能是你的软件安装问题吧,可以拿我们的测试数据测试一下软件; 建议你你用我们的docker镜像吧,我们的软件安装都测试过的; 再就是看看文件有没有异常吧;

回答于 2024-04-19 18:01

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ParaAT 多序列比对 报错 2.0

这个需要测试查看你的输入文件是不有问题;光从你的描述我也不好推断原因; 这些异常的基因都去看看删除一下试试,还有就是文件不要在windows下用记事本修改导致文件兼容问题;编辑用专业的工具并设置:https://www.omicsclass.com/article/395

回答于 2024-04-19 17:59

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circos绘图出现错误,有svg但是内容不对,没有出现png格式的图

那些太短的scaffold去除一下,太多染色体circos会报错;展示染色体就行

回答于 2024-04-19 17:56

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tassel报错:net.maizegenetics.pipeline.TasselPipeline - Tass...

输入的vcf文件格式问题吧,你检查输入文件看看有没有异常

回答于 2024-04-19 11:18

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ANNOVAR注释问题

看看运行过程中最后有没有报错吧, 如果最后有killed字样就表示内存不够导致系统杀死了任务;

回答于 2024-04-19 11:09

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基因组组装相关问题

数据质控,一般测序公司会给质控好的;

回答于 2024-04-18 18:34

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转录组KEGG富集分析出现问题。

我看命令行没有问题,可能你的电脑没有联网吧,你再试试的;

回答于 2024-04-18 18:33

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我有几组16s扩增子数据分别为单端测序和双端测序数据,是否能将...

可以的,你可以先把双端的用flash 软件合并成单端的,再和单端的合并一起用qiime2 导入分析

回答于 2024-04-18 18:29