需要先建GO KEGG注释库,之后才可以做富集分析这里有非模式物种KEGG与GO富集分析课程你看看的:https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM
回答于 2024-04-17 23:12
hifiasm 主要用pacbio ccs的HiFI测序数据组装,你的ONT的数据错误率高 组装不出来;
回答于 2024-04-16 09:00
这里有基因ID,你找到对应ID的cds和蛋白序列检查他们之间是不是3倍关系;确认解决一下; 如果数量不多,可以把这样的基因对删除
回答于 2024-04-15 18:32
窗口和步长没有固定的,你可以根据基因组大小,平均连锁距离来合理设置; 基因组大可以适当加大窗口长度,L D连锁大也可以加大窗口; 也可以多试试几组数据,看看哪个效果好用哪个了;
回答于 2024-04-15 18:29