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3939 个回答

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扩增子分析去除引物序列,怎么看自己的序列数据是否去除了引物,...

理论上影响不大,因为引物也是扩增子的一部分, 但是如果你的引物有简并,最好还是去除一下;

回答于 2024-04-18 15:24

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使用tassel对vcf文件进行 -SortGenotypeFilePlugin 基因型排序时...

可以再检查看看的,可能你没看到吧;

回答于 2024-04-18 14:43

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我现在的数据格式,怎么进行GO和KEGG富集分析呢?

需要先建GO KEGG注释库,之后才可以做富集分析这里有非模式物种KEGG与GO富集分析课程你看看的:https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM

回答于 2024-04-17 23:12

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做PCA分析时报错

有参数输入错误吧,你检查你的命令行:stagestage 分组列名写错了; 看不到你的命令行无法指出错误;

回答于 2024-04-17 23:10

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基因组注释的镜像是否更新过?

没有更新这个软件,放心使用;

回答于 2024-04-16 18:13

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为什么我hifiasm组装出来的文件基本都是空的呢?

hifiasm 主要用pacbio ccs的HiFI测序数据组装,你的ONT的数据错误率高 组装不出来;

回答于 2024-04-16 09:00

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重测序数据可以用来做基因家族的共线性分析

基因家族的收缩和和扩张是相对于不同物种的,需要不同物种基因组数据,重测序数据不能分析

回答于 2024-04-15 21:40

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运行 ParaAT 多序列比对 出现报错

这里有基因ID,你找到对应ID的cds和蛋白序列检查他们之间是不是3倍关系;确认解决一下; 如果数量不多,可以把这样的基因对删除

回答于 2024-04-15 18:32

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能不能回答一下啊 就卡在这 :完全按照脚本粘贴啊

文件路径写错了;检查这个路径下是否有这个脚本,你一层一层的检查文件路径;之后改正;

回答于 2024-04-15 18:30

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如何确定选择分析中的窗口和步长?

窗口和步长没有固定的,你可以根据基因组大小,平均连锁距离来合理设置; 基因组大可以适当加大窗口长度,L D连锁大也可以加大窗口; 也可以多试试几组数据,看看哪个效果好用哪个了;

回答于 2024-04-15 18:29