请使用我们的docker镜像分析数据,避免软件安装错误导致无法分析数据; vcftools没有安装正确可以找你的服务器管理员帮你解决一下;
回答于 2024-04-11 11:48
镜像已经升级,请使用最新的镜像及课程分析数据:https://www.omicsclass.com/article/2371 如果使用老版本的课程,你看看你是不是用错镜像了;导致软件没有找到;
回答于 2024-04-11 08:21
由于与表型关联的SNP附近区域都具有连锁性;并不一定最显著的SNP是关键引起功能差异的SNP,例如,以下文章中起作用的就不是最显著的SNP; 红色箭头处
回答于 2024-04-10 09:34
可以计算IBS: #plink 方法 :plink IBS 方法检测离群样本:https://zzz.bwh.harvard.edu/plink/strat.shtml#outlier plink --vcf all.clean.vcf.gz --cluster --neighbour 1 5 --allow-extra-chr -out outlier_ibs --mds-plot 4 IBD计算不清楚
回答于 2024-04-09 10:11