vcf文件没有建立索引,你需要建立一下: gatk --java-options "-Xmx50g" IndexFeatureFile -I data.vcf.gz
回答于 2024-04-03 14:52
组学大讲堂共享的docker镜像可以使用docker pull直接从dockerhub上下载,可以看看这个课程:https://bdtcd.xetslk.com/s/3Rcvt0
回答于 2024-04-03 11:06
这里有orthoFinder输出文件夹解释,你看看的:https://www.omicsclass.com/article/2011 各个文件夹都看看,打开文件看看的就知道了; 我们也有视频课程,你看看的:https://bdtcd.xetslk.com/s/24yiRs
回答于 2024-04-03 11:03
这个脚本用的是TransDecoder这个软件里面的perl脚本,你自行安装即可,不需要拷贝,软件地址: https://github.com/TransDecoder/TransDecoder
回答于 2024-04-03 11:00
试试 输入示例数据看看是不是抱错; 如果示例数据不抱错,你检查你的数据和示例数据对比有没有不一样的地方;
回答于 2024-04-03 10:58
这几个脚本是这个软件:AGAT: https://github.com/NBISweden/AGAT 你需要自己安装到服务器上才可以使用,不需要从镜像拷贝;
回答于 2024-04-02 20:57
单独的只能一行一个ID,连续的一个大枝可以首尾两个基因分配枝的颜色; 也可以使用iTOL做进化树美化:https://www.omicsclass.com/article/2345
回答于 2024-04-02 10:05
这个在视频课程里面有详细讲解:https://bdtcd.xetslk.com/s/24yiRs
回答于 2024-04-02 10:02