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在基因家族分析的基因结构分析时，运行脚本得到的文件内容，到gs...
你看下你的GFF文件，第三列是CDS的行，行里面最后一列CDS的ID与提取的ID是否对应； 我记得应该要删除一下： CDS：
回答于 2018-11-16 08:38
python_mcscan,error-OSError: [Errno 2] No such file or direc...
自行安装一下这个命令，centos中安装方法：https://www.omicsclass.com/article/527
回答于 2018-11-15 10:39
MEGAX 比对后的gaps删除
可以使用以前版本的MEGA 效果一样的，比如MEGA7；MEGAX没有用过； https://www.omicsclass.com/article/221
回答于 2018-11-14 16:50
共享文件建立以后，提示“Broken shared folder!”错误，然后在操...
最好有截图，不然不好分析你的问题： ll 应该小写，不是大写的，大写的LL会报错无法显示目录内容。 共享文件夹挂载注意事项参考： https://www.omicsclass.com/article/260 biolinux导入视频参考：Linux生信分析环境搭建
回答于 2018-11-14 09:27
水稻cds序列提取
你重新编辑一下你问题， 把输入文件都截图一下，运行的命令截图，脚本粘贴一下；我这边好给你分析原因或者修改一下脚本： 重新编辑问题参考：https://www.omicsclass.com/question/325
回答于 2018-11-13 17:00
MCScanX python -m jcvi.compara.catalog ortholog Fve Med --c...
看你的截图，文件输入没有问题 但是，不知道你的python版本的MCScanX是否安装成功，有可能是软件没有安装成功，建议用我们提供的最新biolinux已经安装好； 我们《基因家族分析视频课程》已经更新这部分内容可以观看了；
回答于 2018-11-13 16:40
没有转录组数据能进行基因家族分析吗？
基因家族分析一般会结合上家族内基因表达数据，假如没有做转录组表达数据也是可以进行分析的；只是少了一部分内容 1. 基因家族鉴定出来后，可以挑选其中的一些基因，再选取一些样品，做实时定量进行表达模式变化分析； 2. 自己没有转录组数据，可以下载其他人上传至NCBI上的数据，只需研究性状及实验设计符合即可，只需跑...
回答于 2018-11-13 13:14
请问如何预测基因家族蛋白的二级结构？
1，你的贴图看，只是介绍结构域，你应该看看这篇文章的方法部分，那里会有怎么鉴定结构域的。 保守结构域可以用hmmer搜索的方法，我们基因家族课程里面讲的很详细：《基因家族里课程》 2.核定位信号，没有做过，你看看这篇文章的方法部分是否有介绍定位方法 3. 新旧版本的ID号，这个不好对应，除非基因组发布作者有...
回答于 2018-11-13 13:08
找不到amazing super circos
这个没用过，可以用circos绘制圈图： https://www.omicsclass.com/video/27
回答于 2018-11-13 13:00
关于操作中遇到的Perl脚本。
目前我们课程里面涉及的脚本语言都是perl语言，没有考虑python，要想生信更进一般建议这两门语言都学习一下；学会了一门编程语言，学习另外一门编程语言也会轻松许多。 目前课程不会涉及python。后续我们也会出python的课程。 如果课程添加python脚本需要重新录制课程，所以目前没有这方面的计划； 更多生物信息perl...
回答于 2018-11-13 09:48