嗯,可以参考下面的文章:https://www.omicsclass.com/article/497
回答于 2018-11-12 18:05
看你的报错也是新手,biolinux上已经有了python 没有必要不要自行安装,安装过程会很麻烦; 源码安装python,请确保每一步都正确完成,再进行下一步; 好多都是权限问题,你可以在命令前面加 sudo;
回答于 2018-11-12 13:31
可参考这个:https://www.omicsclass.com/question/431 小麦基因组约17G 你最少分配80G以上的内存吧,具体没有测试过; 你可以试一下;
回答于 2018-11-11 16:10
1.检查染色体ID 对应关系,不对应可能造成提取失败 2.小麦基因组巨大,在基因组上截取序列需要读入整个基因组,需要消耗很多电脑内存,如果电脑内存不足也会提取失败,因此,建议分染色体做:https://www.omicsclass.com/question/431 , 或者升级电脑内存;
回答于 2018-11-09 11:58
如果是要绘制基因家族共线性分析,类似下图,可将你截图中的<rules> </rules>之间的内容删除: 如果不删除就会得到下图结果,1号染色体和2号染色体条带颜色,4,5号染色体之间的条带颜色不一样:
回答于 2018-11-09 09:17
已知功能的基因库,例如NR库,将自己的基因序列与NR库比对(blastp),比对上的基因具有什么功能,那么我的基因也相似的功能。 NCBI上的blast工具就可以实现。
回答于 2018-11-08 11:28