可以到NCBI上的protein数据库下载相关功能的基因的蛋白序列,利用blastp在普通基因组当中去搜索鉴定,文献可参考: https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-018-4955-8 我们基因家族课程里面也有提到:《基因家族分析视频课程》
回答于 2018-11-08 11:21
你贴图的这个文件(*simple)里面是基因组所有的共线性区域文件(拟南芥 vs 白菜)简化的,一行就是一对共线性区域。 所有基因的共线性关系,一一对应文件:*.anchors.new(详细版本区域内基因一一对应关系),可以在这个文件里面找到所有的拟南芥的WRKY(前面分析的)和白菜的WRKY基因(别人文献下载的),对应关系给筛选出...
回答于 2018-11-08 10:06
可以把这个目录删除,之后再导入: 以前导入过虚拟机,在删除虚拟机的时候注意选择全部删除,不然目录存在,会出现上述问题:
回答于 2018-11-08 09:56
可能GSDS画了基因的外显子结构,就没法再绘制other feature了,具体我没有试过;
回答于 2018-11-06 22:06
黄色框框的数字,不是你的数据,只是提示一下是第多少个数据;你可以数一下; 数据框的操作原理可以观看《R语言入门》
回答于 2018-11-06 13:19
这个需要自己制作,可以看看这个:https://www.omicsclass.com/course/26
回答于 2018-11-05 18:55