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Bioper Kaks计算，没有结构输出，也没有报错?
没有用过bioperl计算KAKS，不太了解； 代码提问，直接贴图，不太友好； 可以把代码txt粘贴，输入文件粘贴一下，感兴趣的人可以帮忙测试一下； 你这样贴图，很少有耐心的人会敲出代码帮你测试，找原因
回答于 2018-11-04 20:38
黄老师，基因家族共线性绘图时，自己所要分析物种的染色体文件fa...
你得知道这两个文件里面存的是什么： family.ctl 存的是拟南芥基因组染色体号，你如果要做你的基因组，你把里面的拟南芥的基因组染色体编号换成自己的，就可以了，不用去下载。 MADS_box_family.txt 文件里面存的是某个基因组家族的所有基因，你换成自己基因组中分析出来的基因家族基因ID就可以了； 所以不是去下载，...
回答于 2018-11-03 21:51
在MCScan目录下，做共线性分析时，遇到了permission denied，请...
MCScanX我们biolinux当中已经安装，请使用课程使用的路径运行MCScanX，自行安装的MCScanX，我这不好说错误原因； 权限问题，可以在命令行前面加sudo；
回答于 2018-11-02 19:23
串联重复基因必须是同一条染色体上的基因吗
串联重复基因当然是相同的染色体了：看看定义: https://www.omicsclass.com/question/1 blast分析的串联重复基因或者大片段复制基因，这个需要自己判断，如果在同一条染色体且距离小于100k时为串联重复；不同文献判断参数有差异；例如下文献： 参考文献：https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s128...
回答于 2018-11-01 21:33
使用circos的时候出现这种问题？求老师解答
建议重新下载我们提供的biolinux的ova包，免去安装的麻烦：路径：/biosoft/circos/circos-0.69-6/bin/circos 如果自行安装，参考：https://www.omicsclass.com/article/519 我们提供的biolinux下载地址：https://pan.baidu.com/s/1ui9ndOsjbtgHrJoxxOcTMQ
回答于 2018-11-01 13:09
请问在Linux中无法创建share文件夹怎么处理？求指导
你截图太少了，我没法给你看出原因；请仔细检查下windows目录名字是否设置正确，提前建立好；linux检查命令行拼写错误，linux下share目录要提前建立好；具体注意事项参考：https://www.omicsclass.com/article/260
回答于 2018-10-31 09:34
老师，分析基因的在染色体上的外显子，内含子，UTR位置信息时，
get_gene_exon_from_gff.pl 这个脚本直接从gff文件里面提取信息，你就别用gffread转换成gtf了，对你来说没用，忽略就行；我记得gffread这行已经注释了； 没用CDS的信息，你查看一下ID，信息对应关系，也就是输入提取的ID和GFF里面的CDS行对应的ID是否一致；
回答于 2018-10-31 09:22