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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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将biolinuz导入虚拟机报错

报错信息提供的太少,我这没法给你分析原因,你可以说一下,你怎么操作的,图文并茂的提问题,我这才好给你分析原因;认真的提问才有别人认真的回答;  问题可以重新编辑,你再编辑一下吧;

回答于 2018-10-11 20:08

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基因组组装没有染色体水平情况下能否做串联重复基因筛选和圈图

没有组装到染色体,可以把scaffold看成染色体来做,但是通常scaffold很多,如果做共线性绘图的话显示的片段太多,不好看;如果非要做的话,你可以选一些片段比较长的scaffold做一下,但是结果肯定是不完整的; 生物学意义:由于scaffold不知道哪些是在一条染色体上的,无法准确的发现基因祖上的大片段的到位复制事件,串联...

回答于 2018-10-11 20:03

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用hmm找蛋白序列,请问过程中遇到这个问题怎么解决

没有用过windows版本的hmm,可能是你的hmm软件没有安装成功,还有输入文件是不是有问题。 建议学习我们的课程:《基因家族分析视频课程》 里面有详细的使用说明。

回答于 2018-10-09 18:24

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nummer共线性分析报错

我的版本是:MUMmer3.23 需要对mummer添加参数重新编译: The size of your reference sequence is larger than is supported by default. You can either break your reference into multiple files and run each individually, or recompile the mummer package with: > make clean > make CPPFLAGS="-O3 -DSIXT...

回答于 2018-10-09 18:19

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输入了.fa文件但是只到了.aln文件这一步出现了下面这个界面,不...

问题描述清楚,用了什么软件,做了什么操作,输入文件是什么?别人才好分析原因,才好回答你的问题。不然只能猜了,请完善一下问题。 如何重新编辑问题:https://www.omicsclass.com/question/325 问题描述示例:https://www.omicsclass.com/question/242

回答于 2018-10-09 12:00

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怎么做3个物种之间的共线性分析

三个物种的共线性可以使用MCScanX来分析: https://www.omicsclass.com/article/275

回答于 2018-10-08 10:48

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同源基因查找E值如何选择

查找不同物种同源基因可以参考这个方法:https://www.omicsclass.com/article/39

回答于 2018-10-08 10:44

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构建好的进化树怎么进行结果分析那?谢谢!

不同的基因家族分类方法不一样,可以多看看文献看一下自己的这个基因家族在别的物种中怎么分析的,找找分析思路; https://www.omicsclass.com/article/459  一些基因家族文章;

回答于 2018-10-08 10:35

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基因家族分析提取启动子序列出现问题,望老师解答

请仔细观看视频,这个脚本不是这么用的:

回答于 2018-10-08 10:32

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拟南芥UVR8有7个RCC1蛋白保守结构域,在之前一些文献的图片中可...

这个具体的结构域你得弄清楚,可能你的基因序列本身就没有连续的,自然就出不来那个图了; 或者你可以试一下选择 full result 显示试一下:https://www.omicsclass.com/article/310  

回答于 2018-10-04 10:56