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基因家族成员鉴定
1.基因家族hmmsearch用的多，uniprot网站上不知道你怎么找的，不好评论； 2.基因差异较大可以适当删除一下gap；https://www.omicsclass.com/article/221 3.如果要删除基因，文章直接写出筛选的e值就可以了；如下： https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-018-4880-x#Sec12
回答于 2018-09-28 19:46
circos.pl运行报错
perl的Config::General 这个包没安装，你需要安装一下，在我们提供的biolinux上是有这个包的； 如果不想安装，请下载安装我们提供的biolinux：https://www.omicsclass.com/question/291 一点建议: 截图不要吝啬，尽量大，尽量多的提供信息，才好回答你的问题。附图之后，再复制粘贴一下文字就更好了；
回答于 2018-09-28 17:55
基因家族分析课程里面，视频中虚拟机里面的共享文件夹share1文件...
1.仔细看第一节ppt参考资料下载方法： 2.我们课程中用的文件都在参照资料当中，如下图所示： scripts文件夹可以自己建立，然后把下载好的perl脚本放进去就好，kaks也是一样的；
回答于 2018-09-27 21:26
What reference assembly does OMIM use for the genomic coordi...
OMIM uses genomic reference build GRCh38 available at ftp://ftp.ncbi.nih.gov/gene/DATA/gene2refseq.gz. If you wish to get genomic coordinates for GRCh37/hg19, that data is available from NCBI at ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov//genomes/H_sapiens/ARCHIVE/ANNOTATION_RELEASE.105/GFF/ref_GRCh37.p13_top_leve...
回答于 2018-09-27 14:50
/sbin/mount.vboxsf: mounting failed with the error: Protocol...
可能在建共享目录的时候哪里设置不对：你按照这个文章检查一下：https://www.omicsclass.com/article/260
回答于 2018-09-25 22:17
请问我在用id提取gff文件时候，已经按照网页上的回答改了perl脚...
这里的用法是perl的正则表达式捕获功能，你的ID里面没有“：” 所以这里出错了,把这个冒号删除试试； 建议学习一下perl《perl入门》《perl高级编程》 perl高级编程里面有正则表达式的详细教程；
回答于 2018-09-25 10:42