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请问一下，我按照问题社区里面的一个问题http://www.omicsclass....
上面提到的方法，只能给出一个hubgene，可参考这个得到多个hub基因：https://www.omicsclass.com/article/381
回答于 2018-09-18 18:32
提取转录本信息时得到空白文件
你检查一下你的输入文件，是否正确，包括格式，ID是否对应等等； 具体你可以把代码，输入文件，部分截图。我好查看错误原因，请修改一下问题，提供更详细的信息。参考别人的提问：https://www.omicsclass.com/question/242 点击编辑就可以重新编写问题了：
回答于 2018-09-18 10:20
进化分析时如何再分为几个亚家族
进化树分析出来一般有个文件，nwk格式的，调整美化（圆形，方形等等）可以参照iTOL使用：https://www.omicsclass.com/article/417 划分亚组，可以根据进化树分支的情况，聚类较近的可以分一个亚家族。
回答于 2018-09-18 10:16
请问有Bio-linux的安装软件及教程吗 biolinux
biolinux官方原版下载地址：http://environmentalomics.org/bio-linux/ biolinux软件安装可参考课程：linux系统使用 虽然原版biolinux已经包含了很多常用生物信息分析软件，但是，还有一些软件没有。因此，我们自行打包了一个biolinux的ova包，在根目录下的biosoft文件夹下我们自己安装了一些软件。方便进行《基因家族分...
回答于 2018-09-18 09:48
筛选不到串联重复基因
串联重复基因的筛选方法： 1.根据相似性筛选详情见：https://www.omicsclass.com/question/1 里面的参数不要降低，降低相似度结果不可靠而且没有依据。 2.还可以根据共线性原理分析得到串联重复基因：MCScanX 这部分分析内容在我们课程：《基因家族视频课程》讲解的很详细了； 再检查一下自己输入的文件是否正确，...
回答于 2018-09-14 10:25
老师，您好！我找不到MEME分析perl脚本，请求帮助！
我们提供的biolinux的ova包，里面我们已经安装好了一些软件，可省去自己安装软件的麻烦。如果你是到biolinux官网下载的ova包，里面哪些我们自己安装的软件是没有的，需要你自行安装。 我们打包好的biolinux的ova包详情见：https://www.omicsclass.com/article/169
回答于 2018-09-13 19:31
三代无参全长转录组做基因家族进化树分析时发现有多条序列的蛋白...
相同的序列应该是基因的不同转录本，你选一条代表序列就好：https://www.omicsclass.com/question/259
回答于 2018-09-13 18:36
WGCNA分析，前期数据载入Rstudio中出现“error reading from conn...
用 getwd() 检查下当前目录下，是否存在上述文件；
回答于 2018-09-13 13:16
老师好，请问怎么找一个家族基因隐马尔科夫模型的索取号
想获得一个基因家族的pfam索引号，首先你得有点线索才行： 1.InterPro数据库直接搜索 知道基因家族的功能描述，可通过pfam提供的关键字搜索得到相应的pfam号：https://www.ebi.ac.uk/interpro/search/text/ 2. 文章搜索 比如，知道基因家族基因的缩写，如，NBS，MYB，AP2，WRKY等等, 就可以搜索一下相关的基因...
回答于 2018-09-13 10:41