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提取上游1500bp报错Bad end parameter (4488)且输出结果不全

你得看看你的基因的位置在scaffold的什么地方,基因位置如果太靠近scaffold的开始,那么基因的前面就不足1500bp的序列供提取上游1500bp的序列,所以没有提取成功; 另外,你也说了你的scaffold总长才:1687bp,再加上基因的长度,哪里还能提出基因上游的1500bp?

回答于 2018-09-05 19:13

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biolinux中的root密码是多少呢,我在var下创建data文件夹的时候...

biolinux用户密码: 用户:manager密码:manager 用户:root密码:manager 更多关于biolinux见:https://www.omicsclass.com/article/169

回答于 2018-09-05 14:02

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《基因家族分析》get_gene_weizhi.pl和get_gene_gff.pl运行结果...

get_gene_weizhi.pl这个脚本你可以修改一下,参考:https://www.omicsclass.com/article/175 get_gene_gff.pl 脚本代码我忘记了,应该也是类似的修改; 建议学习一下perl语言:生物信息perl语言学习视频课程:《perl入门》《perl高级编程》

回答于 2018-09-05 10:36

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样品编号需要注意那些问题?

样品编号命名应该规范,在送样之前就应该考虑好样品的命名,做到命名清晰明了。 为方便计算机分析处理数据,这里总结一下命名方法: 1.样品命名做到:英文字母+数字组成;可以用下划线“_ -”作为分隔符; 2.样品命名不要纯数字 3.样品命名中不要出现中文 4.样品命名不要有特殊字符如:“!@#¥%$&*)(+=” 等等 5.命...

回答于 2018-09-05 10:28

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在使用组学大讲堂中介绍的方法计算Kaks时,系统结果生成的文件里...

没有报错信息吗?  没有报错信息我这也看不出来, 检查你输入的文件是否有问题?

回答于 2018-09-05 10:06

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WGCNA安装以及运行问题?

可以提前单独先安装一下GO.db,见  http://www.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/html/GO.db.html 由于GO.db没有安装成功,所以你的WGCNA包应该是没有加载成功,所以没有这个goodSamplesGenes 方法; 你安装好GO.db之后再安装WGCNA,然后加载WGCNA包后再试一下;

回答于 2018-09-05 10:03

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请问安装Rstudio里面的选项都点不开

应该提前安装R语言的编译环境: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/ 更多可观看《R语言入门视频》

回答于 2018-09-04 19:32

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virtual box导入虚拟机报错VERR_ZIP_CORRUPT

应该是C盘的磁盘空间不足,至少30G空余才行,不然换个磁盘导入; 还有,可能是下载的biolinux的ova包 没有下载完整,或者文件损坏,请重新下载再导入试一下;

回答于 2018-09-04 17:44

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在virtualbox中导入虚拟电脑的bio-linux的ova失败~老师

 VERR_DISK_FULL错误,磁盘空间不足,至少需要30g的磁盘空余。清理一下磁盘。  

回答于 2018-09-03 19:03

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计算串联重复基因的KAKS时,发现KS>1,是不是哪里算错了?用KAKS...

可以看一下这个,了解kaks的意义:https://www.omicsclass.com/article/699

回答于 2018-08-31 17:07