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3933 个回答

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利用360浏览器,访问Pfam数据库,搜某基因家族保守区域的隐马尔...

需要翻墙,看看这个:https://www.omicsclass.com/article/85

回答于 2018-08-30 09:20

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利用perl脚本提取基因上游的1500bp(指定位置)序列时,输出文件...

通过调试,发现,输入的基因位置文件由于在windows当中用editplus编辑过,因此产生的换行符和linux当中不兼容,导致脚本不识别所以没有结果; 建议不要在windows当中操作修改文件再保存,如果要操作一定要统一编码格式utf-8:具体editplus设置方法如下: https://www.omicsclass.com/article/395

回答于 2018-08-29 09:26

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您好 请问我目前有一个miRNA的靶基因预测及GO分析和KEGG分析注释...

可以做的,miRNA对应多个靶基因,多个miRNA的靶基因可能有共有的,这样就会形成网络。 你可以准备miRNA和基因对应的文件,就可以利用cytoscape绘制网络了;

回答于 2018-08-29 09:23

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bioconductor source代码报错

其实bioconductor上已经有解决方法了,仔细看: 去掉s 试一下,就可以用了;

回答于 2018-08-28 22:11

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基因家族鉴定

你说的这个操作起来比较麻烦,你可以直接用NCBI的cdd 验证:https://www.omicsclass.com/article/310

回答于 2018-08-28 17:39

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在进行进化树分析时,拟南芥与我的基因聚不到一起,是怎么回事呢...

聚类不到一起,看看是不是序列差异太大,可以适当删除一些差异太大的区域;

回答于 2018-08-27 12:59

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如何将gi号和taxid的对应文件与taxid和物种注释的对应文件通过ta...

你的问题有些饶,不知道你要得到结果文件是什么样子的,这是ncbi分类数据库的下载地址以及说明,你可以根据文件内容之间的对应关系,写个perl脚本应该可以完成。 分类数据库下载taxid 和gi 的对应文件:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/taxonomy/ 其中的文件1:nodes.dmp tax_id -- node id in GenBank taxonomy datab...

回答于 2018-08-26 13:33

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用phyml画出来的树最后就这样?一点高大上的感觉都没有?

觉得还可以吧,可以用figtree编辑美化一下;https://www.omicsclass.com/article/62 不知道你认为高大上的进化树是什么样的?

回答于 2018-08-26 06:52

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进化树构建完成后是下图的结果 这样分群有木有什么问题?不同颜...

这个有没有问题,得自己根据基因的进化关系了,如果是正常出来的进化树,一般都是没有问题的。

回答于 2018-08-25 21:48

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各位老师,请问怎么下载一个物种整个染色体全基因组的序列信息?...

可到基因组数据库当中下载: 参照JGI数据库网站:https://www.omicsclass.com/article/50 ensembl基因组数据库网站:https://www.omicsclass.com/article/58 如何利用基因组数据库视频课程:https://www.omicsclass.com/video/16

回答于 2018-08-25 21:44