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老师您好，我用mega构建进化树，运行近两天半了还没有出结果，是...
一般序列较多，bootstrap设置1000次构建进化树需要的时间较长；这个和自己的电脑配置有关，以前做过500个基因，bootstrap 设置1000，用时1天时间，不过我们是在大型计算机上完成的； 普通计算机用时会更长。 还有就是选用的方法，ML方法用时最长，NJ法用时会少一些；
回答于 2018-10-14 19:17
基因组数据版本更新导致无法根据旧的蛋白ID或基因locus提取相应...
没有看到图片； 以前的基因，你最好找到以前版本的基因组对应的版本下载下来；然后再找到相应的基因序列； 自己去对应比较麻烦；
回答于 2018-10-14 19:10
将biolinuz导入虚拟机报错
报错信息提供的太少，我这没法给你分析原因，你可以说一下，你怎么操作的，图文并茂的提问题，我这才好给你分析原因；认真的提问才有别人认真的回答； 问题可以重新编辑，你再编辑一下吧；
回答于 2018-10-11 20:08
基因组组装没有染色体水平情况下能否做串联重复基因筛选和圈图
没有组装到染色体，可以把scaffold看成染色体来做，但是通常scaffold很多，如果做共线性绘图的话显示的片段太多，不好看；如果非要做的话，你可以选一些片段比较长的scaffold做一下，但是结果肯定是不完整的； 生物学意义：由于scaffold不知道哪些是在一条染色体上的，无法准确的发现基因祖上的大片段的到位复制事件，串联...
回答于 2018-10-11 20:03
用hmm找蛋白序列，请问过程中遇到这个问题怎么解决
没有用过windows版本的hmm，可能是你的hmm软件没有安装成功，还有输入文件是不是有问题。 建议学习我们的课程：《基因家族分析视频课程》 里面有详细的使用说明。
回答于 2018-10-09 18:24
nummer共线性分析报错
我的版本是：MUMmer3.23 需要对mummer添加参数重新编译： The size of your reference sequence is larger than is supported by default. You can either break your reference into multiple files and run each individually, or recompile the mummer package with: > make clean > make CPPFLAGS="-O3 -DSIXT...
回答于 2018-10-09 18:19