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怎么样从哈希中一次取出多个值
perl 取出多个hash的值，可以用循环： 下面的代码是遍历hash： while(($key, $value) = each(%HASH)) { # do something with $key and $value}#-----------------------------foreach $key (keys %HASH) { $value = $HASH{$key}; # do something with $key and $value}#-----------------------------# %f...
回答于 2018-08-20 20:48
在hmmsearch后，出的结果tlen是不是一定要大于qlen？如果tlen小...
如果是用hmmsearch命令查询我们序列中的保守结构域： target length是我们输入序列总长度；query length 输入的查询序列也就是蛋白结构域的总长度；筛选的时候不应该筛选这两个长度，没有意义；应该看后面的两个from to 看看这两条序列从哪里到哪里比对上了； 一般我们会筛选第7列的E-value值； 要知道怎么筛选先看...
回答于 2018-08-19 08:26
运行MCScanX后，0 match 0discord
第一个截的错误：你所在的目录错误，MCScanX尝试找当前目录下mcscans这个目录，以及AT开头的AT.blast At.gff文件。你确定当前目录下存在我刚说的文件。你的截图我也看不到你当前目录有什么文件，文件是什么样的我都不清楚，无法看出其他原因； 第二个截图是你在自己安装MCScanX软件，截图不全看屏幕上的没有安装成功了；...
回答于 2018-08-17 23:37
bio-linux系统无法启动
看看这个文章最后：https://www.omicsclass.com/article/78 可能是某些设置有问题，你对着检查检查。
回答于 2018-08-17 09:17
用perl批量下载
如果你的基因组在ensembl基因组数据库网站上，看看这个视频可以批量下载：https://www.omicsclass.com/video/16
回答于 2018-08-16 18:44
无参物种可以进行基因家族分析吗？
无参物种可以做基因家族分析。 可以做转录组分析得到unigene以及基因的蛋白质序列，有了蛋白质序列我们就可以通过hmmer搜索鉴定基因家族了。但是，由于没有基因组信息，有些分析是做不了的，比如基因的染色体定位，基因结构，基因的加倍复制等等；效果会比有参的物种做基因家族差一些。
回答于 2018-08-14 09:30
老师Ht-count结果的基因名称有好多MSTRG是什么原因？
你检查你输入的gff或者gtf文件里面是不是有这样的基因ID，如果有的话就没问题。至于什么原因，要问什么？你是不希望出现这些ID，还是这些ID不知道是什么？ 提问之前看看这篇文章：https://www.omicsclass.com/article/82
回答于 2018-08-13 09:45