绕开eclipse的代码管理打开代码,eclipse不知道用什么去运行,所以出现以上情况; 简单的编程,建议用remote system 管理本地和远程的代码,进行打开编辑等:
回答于 2018-08-02 21:47
可以使用bioperl自动翻译:https://www.omicsclass.com/article/179
回答于 2018-07-30 17:44
mutmap分析原理如下图: MutMap适合对EMS诱变的隐性突变基因进行分析。通过EMS诱变和自交得到纯合体后,将突变体和其亲本回交得到F1,F1自交得到的F2后代会出现表型的分离,得到野生型表型群体和突变体表型群体。对这两个群体的DNA分别进行等量混合,得到野生型DNA混池和突变体DNA混池。将两个混池分别进行DNA测序,得到...
回答于 2018-07-30 10:31
可以到JGI批量下载相关功能的基因,搜索家族名字例如NBS,PPR,HSP70等等,参照链接:https://www.omicsclass.com/article/50
回答于 2018-07-27 10:35
你建立的hmm文件有问题吧,总长度473氨基酸?超过了最大限度,你重新截取结构域再建立模型。 或者 请使用我们课程提供的biolinux 里面安装的软件分析,一般不会出错;https://www.omicsclass.com/article/526 你这个可能是安装的hmmer版本不对,请安装:3.1b2 这个版本的hmmer试试;
回答于 2018-07-26 22:32
错误的地方好几处: 1. 35行代码:你的正则表达式书写错误,没有匹配成功,所以 $1,$2 等等也没有捕获成功,都为空; 2. 36行 qw用法有错,记得中间用空格就行,不用逗号 3. 37行代码书写错误,字符串应该用引号引起来; 最后,看看eclipse的提示:错误行,已经出现叹号,说明该行代码有问题,应该仔细检查; 编程基...
回答于 2018-07-26 17:52
TAIR网站用的不是很熟,可以到JGI批量下载相关功能的基因,搜索家族名字例如NBS,PPR,HSP70等等,参照链接:https://www.omicsclass.com/article/50 也可在ensembl上搜索,例如到拟南芥网站:http://plants.ensembl.org/Arabidopsis_thaliana/Info/Index
回答于 2018-07-26 12:05