omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
13893金币数
78120 经验值
432个粉丝
主页被访问 77542 次

3933 个回答

2 赞同

请问老师,一运行就出现这个窗口是什么错误呢?无法运行。

绕开eclipse的代码管理打开代码,eclipse不知道用什么去运行,所以出现以上情况; 简单的编程,建议用remote system 管理本地和远程的代码,进行打开编辑等:

回答于 2018-08-02 21:47

1 赞同

生物信息学分析软件

你这个问题用到的软件很多了,MEGA,MCScanX,beast,DNAman等等。

回答于 2018-07-31 09:41

0 赞同

请问如何将fasta格式的DNA全部翻译成fasta格式的protein呢

可以使用bioperl自动翻译:https://www.omicsclass.com/article/179

回答于 2018-07-30 17:44

0 赞同

mutmap混池定位的测序要求及相应的原理?优势在哪里?

mutmap分析原理如下图: MutMap适合对EMS诱变的隐性突变基因进行分析。通过EMS诱变和自交得到纯合体后,将突变体和其亲本回交得到F1,F1自交得到的F2后代会出现表型的分离,得到野生型表型群体和突变体表型群体。对这两个群体的DNA分别进行等量混合,得到野生型DNA混池和突变体DNA混池。将两个混池分别进行DNA测序,得到...

回答于 2018-07-30 10:31

0 赞同

怎么下载拟南芥中某个基因家族的蛋白序列

可以到JGI批量下载相关功能的基因,搜索家族名字例如NBS,PPR,HSP70等等,参照链接:https://www.omicsclass.com/article/50 

回答于 2018-07-27 10:35

0 赞同

MAGA构建系统发育树时总是报错

差异太大,可以删除gap试试; https://www.omicsclass.com/article/221

回答于 2018-07-26 22:36

0 赞同

老师,您好!hmmsearch自己建立的hmm模型出现报错。

你建立的hmm文件有问题吧,总长度473氨基酸?超过了最大限度,你重新截取结构域再建立模型。 或者 请使用我们课程提供的biolinux 里面安装的软件分析,一般不会出错;https://www.omicsclass.com/article/526 你这个可能是安装的hmmer版本不对,请安装:3.1b2  这个版本的hmmer试试;

回答于 2018-07-26 22:32

0 赞同

请问利用MCScan软件进行共线性分析时,输入的蛋白序列是所有转录...

嗯,输入序列比对时,一个基因对应一条序列。

回答于 2018-07-26 20:01

2 赞同

请问perl正则表达式的捕获中为什么老师只讲了捕获一个变量$1,如...

错误的地方好几处: 1. 35行代码:你的正则表达式书写错误,没有匹配成功,所以 $1,$2  等等也没有捕获成功,都为空; 2. 36行 qw用法有错,记得中间用空格就行,不用逗号 3.  37行代码书写错误,字符串应该用引号引起来; 最后,看看eclipse的提示:错误行,已经出现叹号,说明该行代码有问题,应该仔细检查; 编程基...

回答于 2018-07-26 17:52

0 赞同

怎么下载拟南芥某个基因家族的蛋白序列,用TAIR网站搜索不到,输...

TAIR网站用的不是很熟,可以到JGI批量下载相关功能的基因,搜索家族名字例如NBS,PPR,HSP70等等,参照链接:https://www.omicsclass.com/article/50  也可在ensembl上搜索,例如到拟南芥网站:http://plants.ensembl.org/Arabidopsis_thaliana/Info/Index

回答于 2018-07-26 12:05