fastq文件打开可以看看这个:https://www.omicsclass.com/question/42 找到他们的序列可以到你研究的参考基因下载的网站当中查找。例如,NCBI基因组数据库:https://www.omicsclass.com/article/497 转录组结果看不懂建议学习课程:《有参转录组结果解读》 《无参转录组结果解读》 《转录组数据挖掘》
回答于 2018-11-19 19:34
两种方法应该是有交集的,你说的完全没有交集可能那里做的有问题。 一个不同的基因名字有相同的序列,可能是同源基因吧,或者你再确认一下提取的序列是否有问题。 如果有家族的隐马尔科夫模型pfam号,建议不用blast方法了; 更多方法,可以观看《基因家族文献讲解》
回答于 2018-11-19 17:07
如果是人里面的话,会有一些数据库可以在线完成,例如:https://www.omicsclass.com/article/567
回答于 2018-11-19 16:27
没有偏移,那是行名。 excel打开 你把表头向左移动一下就好了,R输出的格式就是这样的;
回答于 2018-11-19 14:34
左上角行名必须是NAME参照: https://www.omicsclass.com/question/434
回答于 2018-11-16 10:42
你看下你的GFF文件,第三列是CDS的行,行里面最后一列CDS的ID与提取的ID是否对应; 我记得应该要删除一下: CDS:
回答于 2018-11-16 08:38
自行安装一下这个命令,centos中安装方法:https://www.omicsclass.com/article/527
回答于 2018-11-15 10:39
可以使用以前版本的MEGA 效果一样的,比如MEGA7;MEGAX没有用过; https://www.omicsclass.com/article/221
回答于 2018-11-14 16:50