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4121 个回答

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在共线性分析的串联重复时,标黑的脚本报错,我将路径都成我自己...

输入文件的路径文件名都检查一遍,看看都存在或者写的对不。

回答于 2018-11-08 21:29

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老师,我的Fibonacci数据用for循环运行不出来,找不到原因,麻烦...

不好意思,脚本文件可能上传错了,已经更新,只需要吧这两个地方改一下,就好; 

回答于 2018-11-08 18:11

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MCSCANX共线性图代码报错

注意空格:

回答于 2018-11-08 13:35

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相近功能基因的检索方法的具体操作???

已知功能的基因库,例如NR库,将自己的基因序列与NR库比对(blastp),比对上的基因具有什么功能,那么我的基因也相似的功能。 NCBI上的blast工具就可以实现。

回答于 2018-11-08 11:28

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没有染色体信息 只有scaffold MCScanX染色体信息文件 怎么构建

那你就把较长的scaffold当成染色体,照着填写配置文件,分析一下;

回答于 2018-11-08 11:23

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关于隐马可夫文件的作用和构建。

可以到NCBI上的protein数据库下载相关功能的基因的蛋白序列,利用blastp在普通基因组当中去搜索鉴定,文献可参考: https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-018-4955-8 我们基因家族课程里面也有提到:《基因家族分析视频课程》

回答于 2018-11-08 11:21

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老师,课程R语言入门中第5节参考资料里面缺少练习文件: DEG.txt...

谢谢提醒,已经添加:

回答于 2018-11-08 10:20

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不同物种间的共线性分析,如何配置simple文件,在图中标出红色

你贴图的这个文件(*simple)里面是基因组所有的共线性区域文件(拟南芥 vs 白菜)简化的,一行就是一对共线性区域。 所有基因的共线性关系,一一对应文件:*.anchors.new(详细版本区域内基因一一对应关系),可以在这个文件里面找到所有的拟南芥的WRKY(前面分析的)和白菜的WRKY基因(别人文献下载的),对应关系给筛选出...

回答于 2018-11-08 10:06

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Oracle VM VirtualBox管理器不能导入虚拟机

可以把这个目录删除,之后再导入: 以前导入过虚拟机,在删除虚拟机的时候注意选择全部删除,不然目录存在,会出现上述问题:

回答于 2018-11-08 09:56

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使用GSDS绘制转录本结果,other feature选项的没有显示

可能GSDS画了基因的外显子结构,就没法再绘制other feature了,具体我没有试过;

回答于 2018-11-06 22:06