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请问我在用id提取gff文件时候，已经按照网页上的回答改了perl脚...
这里的用法是perl的正则表达式捕获功能，你的ID里面没有“：” 所以这里出错了,把这个冒号删除试试； 建议学习一下perl《perl入门》《perl高级编程》 perl高级编程里面有正则表达式的详细教程；
回答于 2018-09-25 10:42
老师，您好！我看到有些物种的基因组未完成基因组测序，但是做了...
没有基因组，可以做无参转录组对转录本进行拼接，就可以得到转录本序列，然后做基因家族鉴定。 二代测序，或者三代测序都是可以的。
回答于 2018-09-22 17:22
导入linux虚拟电脑时出现错误VBOX_E_FILE_ERROR (0x80BB0004)
ova文件存放的目录路径当中不要有中文试一下。 或者参考：https://www.omicsclass.com/article/426
回答于 2018-09-21 11:15
请问，为什么从官网下载后打不开，重启以后也打不开
建议你学习一下这个课程：biolinux的虚拟机安装见视频课程：《Linux生信分析环境搭建Bio-linux》
回答于 2018-09-21 09:05
请问，如何用mVISTA或者别的软件来分析不同物种叶绿体基因组序列...
比较及共线性分析可以用一下MUMmer这个软件，专门做基因组比较的：http://mummer.sourceforge.net/ 不同物种的叶绿体，可以拿一些叶绿体比较保守的基因做做进化树分析，参照：https://www.omicsclass.com/article/226 ， https://www.omicsclass.com/article/114 叶绿体基因组做的不多，不是很熟。
回答于 2018-09-20 10:17
什么是Scaffold?
A contig is a contiguous length of genomic sequence.A scaffold is composed of contigs and gaps. Gap length can be guessed by incorporating information from paired ends or mate pairs What is a Scaffold?A scaffold is a portion of the genome sequence reconstructed from end-sequenced whole-genome shotg...
回答于 2018-09-20 09:52
基因家族成员命名和定位
你上图中的命名规则我不是很清楚，你不需要理解别人的命名规则， 你要理解自己的数据，基因的信息都记录在基因组的gff文件里面，你仔细看一下gff文件内容，包括基因的位置信息，基因的ID，基因的转录本ID等等信息都有的； GFF3文件说明：https://www.omicsclass.com/article/306 看你截图的文件是gtf格式，这个格式的文...
回答于 2018-09-20 09:43