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有多个时期的转录组数据每个时期都有三个重复，如何进行基因注释
按照我们课程里面的代码，省事的做法建议把fq都cat一起，作为一个混合样本输入进行基因注释； 不然，分别输入有些命令需要相应更改； 课程参考：https://bdtcd.xetslk.com/s/2TnPfm
回答于 2024-02-26 09:57
进化树画图
用的是我们的镜像吗？不是的话可能报错； 进化树绘制，也可以使用一些在线网站绘制： 这个进化树绘制不出来可以使用ITOL或者evolview展示：https://www.omicsclass.com/article/963 https://www.omicsclass.com/article/417
回答于 2024-02-26 09:53
manifest已经是拼接好的如何设置？
拼接好的数据，可以作为单端输入，准备se-33-manifest： sample-id absolute-filepath sample-1 $PWD/some/filepath/sample1_R1.fastq sample-2 $PWD/some/filepath/sample2_R1.fastq 导入命令： qiimetoolsimport\ --type'SampleData[SequencesWithQuality]'\ --input-pathse-33-manifest\ --output-...
回答于 2024-02-26 09:49
jcvi微共线区域(Microsynteny)可视化
这里有课程你可以学习一下：https://bdtcd.xetslk.com/s/24yiRs 见局部共线性那一节
回答于 2024-02-26 09:42
测序数据合并后只有一个fastq文件如何export为全局变量
一个文件用文件路径表示即可；linux基础不好建议学习：https://bdtcd.xetslk.com/s/17gwqZ
回答于 2024-02-26 09:38
Path 'manifest.txt' does not exist.是合并后的数据，export sh...
设置完变量，可以用ll检查一下文件路径是否设置错误，如果错误及时更正； ll $workdir/manifest.ckd.txt
回答于 2024-02-26 09:36