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Beta多样性分析PCOA/NMDS分析无差异,Adonis检验P值小于0.05,怎...

Beta多样性分析PCOA/NMDS分析无差异 这个肉眼看看的比较主观吧

回答于 2024-02-01 13:11

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关于TajimaD计算问题

检查检查你群体里面的样本吧,样本遗传背景差异太大,不属于一个群体有可能导致这样的问题 或者群体数量太少,建议至少10个个体以上吧;

回答于 2024-01-30 12:03

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如何对同一进化树分枝的叶节点进行上下位置的改变

进化树的枝可以旋转,你可以到iTOL网站调整自己的进化树结构; 如果还是不理想,建议你重新构建更好更符合自己预期的进化树:https://www.omicsclass.com/article/2010

回答于 2024-01-30 12:01

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微生物16S测序策略和OTU/ASV分析策略

测序策略都一样,OTU和ASV只是数据分析方法不同;

回答于 2024-01-29 13:14

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微生物16S分析时候,两端测序数据拼接

的确差异挺大的;; 看看这几个样本测序配置文件有没有搞错;合并双端数据看看read1 read2 overlap参数放低看看: Usage: qiime vsearch merge-pairs [OPTIONS]  Merge paired-end sequence reads using vsearch's merge_pairs function. See  the vsearch documentation for details on how paired-end merging is  pe...

回答于 2024-01-29 13:12

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请问老师如何看选择清除分析中的选择信号值?怎么判断受选择基因...

看基因附近的Fst值和pi值高低,局部的结果显示一下

回答于 2024-01-28 20:37

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提取CDS序列失败!!!

还有GFF格式问题,这里的逗号和双引号应该删除,你对比课程里面正常的GFF文件格式; 看看是不是内存不够:https://www.omicsclass.com/question/6544

回答于 2024-01-28 20:34

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wgd解析运行不了??

请按照视频课程中的操作启动相应的镜像,到docker容器里面分析数据,服务器上默认有些软件没有安装;

回答于 2024-01-28 15:13

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单细胞测序分析时快速找出所有细胞类型的差异/Marker基因,执行...

可能是marker差异基因没找到,你换个方法: 比如 wilcox,降低阈值等再试试;

回答于 2024-01-28 15:12

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老师您好,请问我mac电脑如何启动镜像

注意冒号: 我们的课程已经更新qiime2最新了,了解一下:https://www.omicsclass.com/article/2371

回答于 2024-01-28 15:08