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如何自己制作泛基因组的pangene.list呢

这里有课程讲解列表生成: 组学大讲堂 发现一节好课 动植物泛基因组分析实操 点击学习:https://bdtcd.xetlk.com/s/lIqL9

回答于 2024-11-11 18:16

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gwas分析报错

内存不够看看这里:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2024-11-07 16:10

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SRA下载

对的可以的,把这个命令多复制几遍,一条代码一行放在shell文件里面: ascp.sh,然后后台运行, nohup sh ascp.sh >ascp.sh.o&

回答于 2024-11-07 11:02

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SRA数据下载

数据下载可以看看这个:https://www.omicsclass.com/article/964 https://www.omicsclass.com/article/2383 wget 加上-c参数支持续传;

回答于 2024-11-07 09:22

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老师,在第三步vcf文件过滤时,得到的all.clean.vcf文件太小了,...

 --minGQ 这个参数一般不设置,你去掉试试 , 他过滤的很严格;

回答于 2024-11-07 09:20

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同学你好,请问你能找到pan-genome:v1.0这个镜像吗?我登上去发...

docker hub 国内上不了了,如果购买我们课程可以 : 联系客服处理:点击联系客服

回答于 2024-11-01 22:26

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物种注释出现killed,我调了参数还是出现这个问题,除了用台式机...

电脑内存不够系统自动杀死了任务,可以租用我们的云服务器:视频课程https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2024-11-01 22:24

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docker search omicsclass中没有pop-evol-gwas:latest了

docker hub 国内上不了了,如果购买我们课程可以 : 联系客服处理:点击联系客服

回答于 2024-11-01 22:21

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OrthoFinder 脚本

这里统计的是在所有物种中都存在的单拷贝直系同源基因,所以数目一样;是正常现象:

回答于 2024-10-31 13:41

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infercnv error in readrds(reload_info$expected_file_names[[i...

infercnv的输出目录删除之后重新运行infercnv解决;

回答于 2024-10-31 10:48